RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 CDIPTO14735 213 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 GATA3P23771 443 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 CPT2P23786 658 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 CFHR2P36980 270 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 PITPNBP48739 271 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 GPM6AP51674 278 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 OR12D2P58182 307 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 GNB2P62879 340 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 PAX2Q02962 417 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.74□□□□□ -0.53
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SRRT-210ENST00000477529 TMEM42Q69YG0 159 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DOK3Q7L591 496 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 RNF170Q96K19 258 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 OR8B2Q96RD0 313 aa11.74□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ZNF649Q9BS31 505 aa11.74□□□□□ -0.53
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SRRT-210ENST00000477529 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 A6NIN4 97 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ZNF732B4DXR9 585 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 H3BSH0 61 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 FCN3O75636 299 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 IFNA2P01563 188 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ZNF12P17014 697 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ADRA2CP18825 462 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 SRP14P37108 136 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ACTA2P62736 377 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 GNG3P63215 75 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ACTG2P63267 376 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 RAB40BQ12829 278 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 KCNJ8Q15842 424 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 FDX2Q6P4F2 183 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 OR52I1Q8NGK6 324 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 OR10Z1Q8NGY1 313 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 OR2G2Q8NGZ5 317 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 CYGBQ8WWM9 190 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 SEH1LQ96EE3 360 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 PELI1Q96FA3 418 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ADI1Q9BV57 179 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 OR51I2Q9H344 312 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DCLRE1BQ9H816 532 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 SMURF1Q9HCE7 757 aa11.73□□□□□ -0.53
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SRRT-210ENST00000477529 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 OR5V1Q9UGF6 321 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 OPN4Q9UHM6 478 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 INSIG2Q9Y5U4 225 aa11.73□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 SYT7O43581 403 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 RHBDL1O75783 438 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 NRASP01111 189 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 FSHBP01225 129 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 GYPAP02724 150 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 GNAO1P09471 354 aa11.72□□□□□ -0.53
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SRRT-210ENST00000477529 GALEQ14376 348 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 TTC23Q5W5X9 447 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 MOB3CQ70IA8 216 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 LHFPL3Q86UP9 236 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 C4orf36Q96KX1 117 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 C7orf69Q9H7B7 122 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 PLEKHA1Q9HB21 404 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 GPR173Q9NS66 373 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 FRRS1LQ9P0K9 344 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 CLN8Q9UBY8 286 aa11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 A0A1B0GW55 424 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ANKRD61A6NGH8 418 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 AKR7A2O43488 359 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ADAM20O43506 726 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DUX4L3P0CJ86 424 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DUX4L4P0CJ87 422 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DUX4L5P0CJ88 424 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DUX4L7P0CJ90 424 aa11.71□□□□□ -0.53
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