RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 JAGN1Q8N5M9 183 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 OR6K3Q8NGY3 331 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 GPX8Q8TED1 209 aa5.2□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 AQP3Q92482 292 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.582e-6■■■□□ 17.6
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C6orf48-208ENST00000395788 KCNK15Q9H427 330 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 OPA3Q9H6K4 179 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 SCPEP1Q9HB40 452 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 COPZ2Q9P299 210 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV18A0A075B6X5 111 aa5.19□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MEIOCA2RUB1 952 aa5.19□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 WDR1O75083 606 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TNFSF13O75888 250 aa5.19□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CHRM2P08172 466 aa5.19□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 NAT1P18440 290 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PRKACBP22694 351 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 STOMP27105 288 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TIMP3P35625 211 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PTGFRP43088 359 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 OR3A4PP47883 348 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 INPP1P49441 399 aa5.19□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TDGF1P3P51864 188 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 RAB1AP62820 205 aa5.19□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNF92Q03936 586 aa5.19□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 KISS1Q15726 138 aa5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 FAM189A2Q15884 450 aa5.19□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TM2D1Q9BX74 207 aa5.19□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.19□□□□□ -1.58
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C6orf48-208ENST00000395788 A0A0A6YYD4 124 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 C7orf66A4D0T2 115 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 METTL21EPA6NDL7 271 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 HMX3A6NHT5 357 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CENPXA8MT69 81 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CDC14BO60729 498 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CA11O75493 328 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 RBBP9O75884 186 aa5.18□□□□□ -1.58
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