RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364005.1

RNU6-340P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 340, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-340P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-340P-201ENST00000364005 OR1L6Q8NGR2 347 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ERMNQ8TAM6 284 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 BAALCQ8WXS3 180 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 TAMM41Q96BW9 452 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 PRRC1Q96M27 445 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 OMDQ99983 421 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 PECRQ9BY49 303 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 TM6SF2Q9BZW4 377 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 LIPT1Q9Y234 373 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 MEMO1Q9Y316 297 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 WNK1Q9H4A3 2382 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ELP1O95163 1332 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 A0A087WX48 190 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 RGSL1A5PLK6 1076 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 F5H5P2 479 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 SDHDO14521 159 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 HSF2BPO75031 334 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 POP7O75817 140 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 MT-CO2P00403 227 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 CA3P07451 260 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 EPB41P11171 864 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 PSMA2P25787 234 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 IL3RAP26951 378 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 GNA11P29992 359 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 GNRHRP30968 328 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 HSD17B2P37059 387 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 MAP2K4P45985 399 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 RAB9AP51151 201 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 NME5P56597 212 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 OR2B6P58173 313 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 IFITM3Q01628 133 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF90Q03938 601 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 GGTA1PQ4G0N0 100 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 MFSD14CQ5VZR4 134 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 OR6B2Q6IFH4 312 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ARL10Q8N8L6 244 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 MINDY2Q8NBR6 621 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 CXorf40BQ96DE9 158 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 TTC25Q96NG3 672 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 SH3GL1Q99961 368 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ACAT2Q9BWD1 397 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 TXLNGYQ9BZA5 131 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 IL22Q9GZX6 179 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 MFFQ9GZY8 342 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 LRRN3Q9H3W5 708 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 CST9LQ9H4G1 147 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ANKEF1Q9NU02 776 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 DCAF16Q9NXF7 216 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 PIPOXQ9P0Z9 390 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 HEY1Q9Y5J3 304 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 PDZK1P1A8MUH7 402 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 OR2T1O43869 369 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 RRASP10301 218 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 PSKH1P11801 424 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 MLNP12872 115 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 IFITM1P13164 125 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 GGT1P19440 569 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 HTR2CP28335 458 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 SPRR2BP35325 72 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 SLCO1A2P46721 670 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 REG1BP48304 166 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 NDUFA8P51970 172 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 NAPAP54920 295 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 RWDD2BP57060 319 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ACTG2P63267 376 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 NAB1Q13506 487 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 TRIP10Q15642 601 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 GPR107Q5VW38 600 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 KCNIP4Q6PIL6 250 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 DHDDSQ86SQ9 333 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ITPRIPQ8IWB1 547 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 PRELID2Q8N945 189 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZDHHC22Q8N966 263 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 OR10T2Q8NGX3 314 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 FAM57AQ8TBR7 257 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 MBD3L1Q8WWY6 194 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 CDS1Q92903 461 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 SNX21Q969T3 373 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 PYURFQ96I23 114 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-340P-201ENST00000364005 GLT1D1Q96MS3 346 aa-1.64□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms