RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 EPOPA6NHQ4 379 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 BCL2L11O43521 198 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 C1orf105O95561 183 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SOD1P00441 154 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SCG5P05408 212 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 TRGC1P0CF51 173 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 TACR1P25103 407 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 HTR1EP28566 365 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SRD5A2P31213 254 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 DPTQ07507 201 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 LTC4SQ16873 150 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF585BQ52M93 769 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 NOXRED1Q6NXP6 359 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 PARM1Q6UWI2 310 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 ADCK2Q7Z695 626 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SLC26A10Q8NG04 563 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 FGF14Q92915 247 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 MYADMQ96S97 322 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CDCA4Q9BXL8 241 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CA10Q9NS85 328 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SLC23A2Q9UGH3 650 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 VPREB3Q9UKI3 123 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 KNL1Q8NG31 2342 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 C2orf16Q68DN1 1984 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1B0GU03 582 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 GAGE12BA1L429 117 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 GGT3PA6NGU5 568 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 OR2C1O95371 312 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CDS2O95674 445 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SLC35G6P0C7Q6 338 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 OR5H8P0DN80 308 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 IGFBP4P22692 258 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 AGTR1P30556 359 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CRYBB2P43320 205 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 PLP1P60201 277 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 UBE2KP61086 200 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 ZSWIM7Q19AV6 140 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SLC25A53Q5H9E4 307 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 PODNL1Q6PEZ8 512 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 OR8I2Q8N0Y5 310 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF480Q8WV37 535 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 RNF141Q8WVD5 230 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 KLK6Q92876 244 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 NEIL2Q969S2 332 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 PLEKHA1Q9HB21 404 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SLC7A10Q9NS82 523 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 ASIC5Q9NY37 505 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 OR1A2Q9Y585 309 aa4.4□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 GON4LQ3T8J9 2241 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 E9PQ18 207 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 GNGT2O14610 69 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 NME6O75414 186 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CHRM2P08172 466 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM225BP0DP42 221 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF19P17023 458 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CD27P26842 260 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 DCTP40126 519 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 PIGPP57054 158 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 RPS23P62266 143 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CDK3Q00526 305 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 GINS1Q14691 196 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 KIAA0040Q15053 153 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 Q6ZTK2 550 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 OLIG3Q7RTU3 272 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 FADS6Q8N9I5 356 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 SFXN5Q8TD22 340 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 OR4K3Q96R72 315 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 CLDND1Q9NY35 253 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.39□□□□□ -1.71
CLVS1-201ENST00000325897 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms