RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CCL26Q9Y258 94 aa14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OTOFQ9HC10 1997 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 PIGTQ969N2 578 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HKR1P10072 659 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 IL9P15248 144 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR1D4P47884 311 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 SEC13P55735 322 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR1P1Q8NH06 330 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR4F5Q8NH21 305 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR4F4Q96R69 305 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 MSL2Q9HCI7 577 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 FAM221AA4D161 298 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 TLCD2A6NGC4 264 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 WBP1LQ9NX94 342 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.83□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RP1P56715 2156 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BKO60814 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 THY1P04216 161 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BJP06899 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 MYOGP15173 224 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BOP23527 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BBP33778 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BDP58876 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BCP62807 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 EMC4Q5J8M3 183 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 SGCZQ96LD1 299 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 WDR90Q96KV7 1748 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 CD82P27701 267 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 SLC6A8P48029 635 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 CLN3Q13286 438 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RUNX2Q13950 521 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 MED25Q71SY5 747 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 BIVMQ86UB2 503 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 INSL6Q9Y581 213 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RAMP1O60894 148 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR10J1P30954 320 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 TPPP2P59282 170 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 UEVLDQ8IX04 471 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RNF122Q9H9V4 155 aa14.82□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 DYRK2Q92630 601 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PQU0 124 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 PRSS37A4D1T9 235 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OPN1LWP04000 364 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 MESTQ5EB52 335 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 WBP1Q96G27 269 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 TAAR9Q96RI9 348 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RNF24Q9Y225 148 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 FGF19O95750 216 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 P2RY1P47900 373 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 BTG2P78543 158 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 MPV17LQ2QL34 196 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms