RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276573.11

TRIM55-201, Transcript of tripartite motif containing 55, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM55, Length 1,960 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55-201ENST00000276573 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 PIGCQ92535 297 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 HYLS1Q96M11 299 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CHST6Q9GZX3 395 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 IFT46Q9NQC8 304 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 NPTNQ9Y639 398 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.31□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 C5orf49A4QMS7 147 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 MFNGO00587 321 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ZNHIT1O43257 154 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 RAD51DO75771 328 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CCL2P13500 99 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 NAT1P18440 290 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CCNOP22674 350 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 MPZP25189 248 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ATP1B3P54709 279 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CXADRP78310 365 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 Q5BKY6 102 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 OR52W1Q6IF63 320 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CD163Q86VB7 1156 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 BORCS8Q96FH0 119 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 METTL9Q9H1A3 318 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ZNF69Q9UC07 566 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 STARD10Q9Y365 291 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 RGS13O14921 159 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 HTR3BO95264 441 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 TBPP20226 339 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 SARAFQ96BY9 339 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 TECTBQ96PL2 329 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 TRIB1Q96RU8 372 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 PECRQ9BY49 303 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 DLL4Q9NR61 685 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.3□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ANGPTL7O43827 346 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 SERPINA5P05154 406 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CSN2P05814 226 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CPT2P23786 658 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CBX5P45973 191 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 MALLQ13021 153 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ARFRP1Q13795 201 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ARL6IP1Q15041 203 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 RSU1Q15404 277 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 OR4K15Q8NH41 348 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CCDC107Q8WV48 283 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 SNAPC3Q92966 411 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CYYR1Q96J86 154 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 Q96M66 194 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ZNF75AQ96N20 296 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 PRRT1Q99946 306 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 TMEM82A0PJX8 343 aa8.28□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.28□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CA11O75493 328 aa8.28□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 NGFP01138 241 aa8.28□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 PMP2P02689 132 aa8.28□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 HRH1P35367 487 aa8.28□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 APLNRP35414 380 aa8.28□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRIM55-201ENST00000276573 ZMYND11Q15326 602 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms