RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 OGFOD3Q6PK18 319 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 OR8U1Q8NH10 309 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SECTM1Q8WVN6 248 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 C7orf77A4D0Y5 90 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 AWAT1Q58HT5 328 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC16A13Q7RTY0 426 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 BANF2Q9H503 90 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 NIT2Q9NQR4 276 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 MED29Q9NX70 200 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PRR13Q9NZ81 148 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIOO75962 3097 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 THADAQ6YHU6 1953 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 AGPAT2O15120 278 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 DANCRP0C864 163 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 GIMD1P0DJR0 217 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 MAS1LP35410 378 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM33P57088 247 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 RAB1AP62820 205 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SPEM2Q0P670 501 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 CHRFAM7AQ494W8 412 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TTLL10Q6ZVT0 673 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SGPP2Q8IWX5 399 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 DECR2Q9NUI1 292 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 LUZP4Q9P127 313 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 AMDHD2Q9Y303 409 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PRF1P14222 555 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 RAB5AP20339 215 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 C17orf67Q0P5P2 114 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 FABP9Q0Z7S8 132 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 OR2A2Q6IF42 318 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 OR1J1Q8NGS3 322 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 C5orf34Q96MH7 638 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 GPER1Q99527 375 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 RAB33BQ9H082 229 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SMDT1Q9H4I9 107 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 LHFPL6Q9Y693 200 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A0C4DFX4 3053 aa20.11■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 HTR3BO95264 441 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PTGER4P35408 488 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 OR1D4P47884 311 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 BIDP55957 195 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 C1QL4Q86Z23 238 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 WDFY1Q8IWB7 410 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 OR8B12Q8NGG6 310 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR84Q9NQS5 396 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 LIPT2A6NK58 231 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 E5RGE8 158 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 H3BMH7 237 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 NSDHLQ15738 373 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 GUK1Q16774 197 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM209BQ5JX69 171 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 HIST2H3AQ71DI3 136 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 OR51T1Q8NGJ9 327 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SPACA5Q96QH8 159 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SCRT1Q9BWW7 348 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TM2D1Q9BX74 207 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 NSG2Q9Y328 171 aa20.1■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A1B0GW64 132 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PIAS2O75928 621 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ACKR3P25106 362 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 COMMD2Q86X83 199 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SERINC1Q9NRX5 453 aa20.09■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 NAT2P11245 290 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF17P17021 662 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR157Q5UAW9 335 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 RNF144BQ7Z419 303 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SULF2Q8IWU5 870 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 GINS3Q9BRX5 216 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PBDC1Q9BVG4 233 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PECRQ9BY49 303 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54-201ENST00000215941 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54-201ENST00000215941 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54-201ENST00000215941 GABREP78334 506 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNMB1Q16558 191 aa20.08■□□□□ 0.8
ANKRD54-201ENST00000215941 MIDNQ504T8 468 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms