RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637132.1

CACNB4-241, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, humanhuman

TSL 5

Gene CACNB4, Length 3,877 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB4-241ENST00000637132 ZNF225Q9UK10 706 aa3.16□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 J3QRE1 110 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 XRCC2O43543 280 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 PNPP00491 289 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 CST1P01037 141 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 FBP1P09467 338 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 OR2T7P0C7T2 308 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 PRG2P13727 222 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 ZNF20P17024 532 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 CRHBPP24387 322 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 LAP3P28838 519 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 GABRA5P31644 462 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 BRS3P32247 399 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 PTGDSP41222 190 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 MAP2K3P46734 347 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 PITPNBP48739 271 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 MVDP53602 400 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 P2RX3P56373 397 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 ISL1P61371 349 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 SLC35A2P78381 396 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 DYRK1AQ13627 763 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 MPPED2Q15777 294 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 NEDD8Q15843 81 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 SNAPC1Q16533 368 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 GGNQ86UU5 652 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 DTX2Q86UW9 622 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 CBR4Q8N4T8 237 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 NUP37Q8NFH4 326 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 OR2T27Q8NH04 317 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 OR52J3Q8NH60 311 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 SLC7A6Q92536 515 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 PROK2Q9HC23 129 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa3.15□□□□□ -1.9
CACNB4-241ENST00000637132 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 A0A1B0GW55 424 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 BHLHE40O14503 412 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 OGG1O15527 345 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 OIP5O43482 229 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 ARL6IP5O75915 188 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 GPANK1O95872 356 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 SOD3P08294 240 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 CRISP1P54107 249 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 GUCA2AQ02747 115 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 LRFN4Q6PJG9 635 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 MKXQ8IYA7 352 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 OR1F12Q8NHA8 337 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 POC1BQ8TC44 478 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 ST8SIA4Q92187 359 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 HTRA1Q92743 480 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 PHF21AQ96BD5 680 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 CMBLQ96DG6 245 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 IL36GQ9NZH8 169 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 JKAMPQ9P055 326 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DUX4Q9UBX2 424 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 PLCE1Q9P212 2302 aa3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CACNB4-241ENST00000637132 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms