RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 MAB21L1Q13394 359 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 SSX6Q7RTT6 188 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ZNF679Q8IYX0 411 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 OR10H4Q8NGA5 316 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 RFKQ969G6 155 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 SPSB4Q96A44 273 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 TIMD4Q96H15 378 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 LYZL4Q96KX0 146 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 NIPAL2Q9H841 368 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 GCM1Q9NP62 436 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 CLN6Q9NWW5 311 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 FAM157AC9JC47 383 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 DLGAP1O14490 977 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 TMPRSS2O15393 492 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ZNF254O75437 659 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 PNPP00491 289 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 GRPP07492 148 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 OR2T7P0C7T2 308 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 PEX2P28328 305 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 DDOSTP39656 456 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 PMELP40967 661 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 LMO4P61968 165 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ROM1Q03395 351 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 SLC3A1Q07837 685 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ODF1Q14990 250 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 MPPED2Q15777 294 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 MIDNQ504T8 468 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 FAM201AQ5SY85 155 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 OR2T27Q8NH04 317 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 RNFT2Q96EX2 444 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 MNTQ99583 582 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 OPA3Q9H6K4 179 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 AMBNQ9NP70 447 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 FAM206AQ9NX38 181 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 NPTNQ9Y639 398 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GWJ7 208 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 TMEM178BH3BS89 294 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PHYHO14832 338 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SLC16A6O15403 523 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 GMDSO60547 372 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 CLIC3O95833 236 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 GABRB1P18505 474 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ACKR3P25106 362 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 DCTDP32321 178 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 CD200P41217 278 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 MTNR1AP48039 350 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 EGR3Q06889 387 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 TMED1Q13445 227 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PRR31Q5SQ13 230 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 FDX2Q6P4F2 183 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 COMMD2Q86X83 199 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 OR51E1Q8TCB6 317 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 CYGBQ8WWM9 190 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 PIGCQ92535 297 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 GAL3ST1Q99999 423 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SLC22A4Q9H015 551 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms