RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35F2Q8IXU6 374 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 HS3ST5Q8IZT8 346 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 YIPF7Q8N8F6 280 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 DTX3Q8N9I9 347 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 OR1M1Q8NGA1 313 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5A2Q8NGI9 324 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10S1Q8NGN2 331 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2AE1Q8NHA4 323 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 NPRL2Q8WTW4 380 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 LRTOMTQ8WZ04 291 aa4.71□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A28Q96A46 364 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 SGK3Q96BR1 496 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF170Q96K19 258 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 RDH12Q96NR8 316 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 APOL4Q9BPW4 351 aa4.71□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 POFUT1Q9H488 388 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM165Q9HC07 324 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 INPP5EQ9NRR6 644 aa4.71□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 NUP50Q9UKX7 468 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 PIGLQ9Y2B2 252 aa4.71□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 LRP12Q9Y561 859 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.71□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 R4GMQ9 66 aa4.71□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 DAPL1A0PJW8 107 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 BTBD17A6NE02 478 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 SAC3D1A6NKF1 404 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 F5H0A9 414 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 C3orf80F5H4A9 247 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 H0YL77 283 aa4.7□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 MAB21L1Q13394 359 aa4.7□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 SIGLEC11Q96RL6 698 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 CIB1Q99828 191 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 PKP2Q99959 881 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM246Q9BRR3 403 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 COMMD4Q9H0A8 199 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 USE1Q9NZ43 259 aa4.7□□□□□ -1.66
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