RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 DIRC2Q96SL1 478 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ALG8Q9BVK2 526 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 BRD7Q9NPI1 651 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 SCN3BQ9NY72 215 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 GNG8Q9UK08 70 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.34□□□□□ -1.23
CLSTN3-212ENST00000541770 CD300LBA8K4G0 201 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 J3QLI3 93 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 J3QLW9 94 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC1A7O00341 560 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TTRP02766 147 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CD55P08174 381 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 LIMS3P0CW19 117 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 LIMS4P0CW20 117 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF19P17023 458 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MYL12AP19105 171 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF81P51508 661 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CCR9P51686 369 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR12D2P58182 307 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC35A2P78381 396 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM3AP98173 230 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR8B8Q15620 311 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TP53I3Q53FA7 332 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 RNLSQ5VYX0 342 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 Q6ZR03 302 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 Q6ZSR3 168 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 KRT74Q7RTS7 529 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 STX19Q8N4C7 294 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PELI1Q96FA3 418 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 LYZL4Q96KX0 146 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 C4orf36Q96KX1 117 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CNBD2Q96M20 576 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC22A4Q9H015 551 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.33□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GGT3PA6NGU5 568 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 RP2O75695 350 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV1-46P01743 117 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CDK1P06493 297 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CCL1P22362 96 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TNFSF4P23510 183 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CRHBPP24387 322 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TGM4P49221 684 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GSK3AP49840 483 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ETV1P50549 477 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CCL8P80075 99 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 LCN2P80188 198 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 BAMBIQ13145 260 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC58Q4VC31 144 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 AHSA2Q719I0 299 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 KLBQ86Z14 1044 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5AS1Q8N127 324 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 FTMTQ8N4E7 242 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR52N1Q8NH53 320 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MYDGFQ969H8 173 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 DUSP21Q9H596 190 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MSL2Q9HCI7 577 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM100Q9NV29 134 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.32□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ISPDA4D126 451 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CLDN25C9JDP6 229 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PTGES3LE9PB15 166 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MLNRO43193 412 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SPRY3O43610 288 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GMDSO60547 372 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms