RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 MZT2AQ6P582 158 aa7.58□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 FAM57BQ71RH2 274 aa7.58□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.58□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 NAA40Q86UY6 237 aa7.58□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.58□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.58□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 ASB5Q8WWX0 329 aa7.58□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 GINS4Q9BRT9 223 aa7.58□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 SLITRK2Q9H156 845 aa7.58□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 FAM74A7A6NL05 159 aa7.57□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 M0R135 149 aa7.57□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 ITGA5P08648 1049 aa7.57□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.57□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.57□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 GAL3ST1Q99999 423 aa7.57□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.57□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.57□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 ZNF273Q14593 569 aa7.57□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 BEX5Q5H9J7 111 aa7.57□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.57□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 SOX7Q9BT81 388 aa7.57□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.57□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.57□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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THBS3-210ENST00000541576 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 SHEQ5VZ18 495 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 C11orf88Q6PI97 169 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 DRAM2Q6UX65 266 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 GFRALQ6UXV0 394 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZT83 130 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZTK2 550 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 GPR84Q9NQS5 396 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 CKLFQ9UBR5 152 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-210ENST00000541576 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.56□□□□□ -1.2
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