RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 PLAGL1Q9UM63 463 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 KCNK6Q9Y257 313 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 PIAS3Q9Y6X2 628 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0J9YY10 115 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 HMGN4O00479 90 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 CXCL2P19875 107 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 PPIAP62937 165 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 UBE2V2Q15819 145 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF79Q15937 498 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MICBQ29980 383 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 RNF175Q8N4F7 328 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 STACQ99469 402 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 CD207Q9UJ71 328 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 OR1A2Q9Y585 309 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 A8MXK9 166 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 NXPH3O95157 252 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 CD99P14209 185 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 DUSP1P28562 367 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 COX20Q5RI15 118 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 OR1S1Q8NH92 325 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 OR8U8P0C7N1 319 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 TFPIP10646 304 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 HLA-DOBP13765 273 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 CHRNB4P30926 498 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 FCGR2CP31995 323 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 C10orf111Q8N326 155 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 R3HDM4Q96D70 268 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ASCL3Q9NQ33 180 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 VAX2Q9UIW0 290 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MMACHCQ9Y4U1 282 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MYOFQ9NZM1 2061 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PPV4 95 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MARCH11A6NNE9 402 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 TMPRSS11DO60235 418 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 HPXP02790 462 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ACTR1BP42025 376 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 NPBWR2P48146 333 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ACTR1AP61163 376 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 C2orf27AQ580R0 203 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 PHF19Q5T6S3 580 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 SLC22A24Q8N4F4 322 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 FGF14Q92915 247 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 TM4SF19Q96DZ7 209 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 TAAR9Q96RI9 348 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 GCM1Q9NP62 436 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 COA4Q9NYJ1 87 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PQF6 199 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 NDUFA2O43678 99 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 SEMA4FO95754 770 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINE2P07093 398 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 GP1BBP13224 206 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 OTX2P32243 289 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 SLC6A9P48067 706 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 UBE2G2P60604 165 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 BAXQ07812 192 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 SLC22A6Q4U2R8 563 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 IER5LQ5T953 404 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 FA2HQ7L5A8 372 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM156Q8N614 296 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 NINJ1Q92982 152 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 FGF22Q9HCT0 170 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 NOX4Q9NPH5 578 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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