RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 VPS33AQ96AX1 596 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC58Q96CX6 371 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TEX37Q96LM6 180 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SAMD8Q96LT4 415 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FNDC11Q9BVV2 318 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 BPESC1Q9GZL8 116 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NANOGQ9H9S0 305 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 EFCAB1Q9HAE3 211 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 VAPAQ9P0L0 249 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CD300AQ9UGN4 299 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IL19Q9UHD0 177 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SLC7A7Q9UM01 511 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 BAIAP2Q9UQB8 552 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CR1P17927 2039 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PRQ8 180 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CLDN24A6NM45 220 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 C17orf51A8MQB3 221 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 A8MXK9 166 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 M0QX08 132 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MRASO14807 208 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 E2F6O75461 281 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 UPK3AO75631 287 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 KRT36O76013 467 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFB2O95178 105 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RPSAP08865 295 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 QDPRP09417 244 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FCGR1AP12314 374 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 B4GALT1P15291 398 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FUT1P19526 365 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 KITLGP21583 273 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PAICSP22234 425 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 STOMP27105 288 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 KDELR2P33947 212 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 DDOSTP39656 456 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FUT6P51993 359 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NME5P56597 212 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 HILS1P60008 231 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CD81P60033 236 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 DGCR6Q14129 220 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CARTPTQ16568 116 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IFI44LQ53G44 452 aa3.53□□□□□ -1.84
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HDAC2-216ENST00000523628 KRT80Q6KB66 452 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 C11orf88Q6PI97 169 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 DLEU7Q6UYE1 221 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 B3GLCTQ6Y288 498 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SVOPLQ8N434 492 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM86BQ8N661 226 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR52I2Q8NH67 350 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SPTSSAQ969W0 71 aa3.53□□□□□ -1.84
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HDAC2-216ENST00000523628 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR52B2Q96RD2 323 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RACGAP1Q9H0H5 632 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 KCNK15Q9H427 330 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MIOXQ9UGB7 285 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 AURKCQ9UQB9 309 aa3.53□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RTTNQ86VV8 2226 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0G2JND7 137 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PPE2 198 aa3.52□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PR64 198 aa3.52□□□□□ -1.85
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