RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PRMT2P55345 433 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 NTHL1P78549 312 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 DEFB103AP81534 67 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MADCAM1Q13477 382 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RUNX3Q13761 415 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 LTB4RQ15722 352 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 GRK1Q15835 563 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ISXQ2M1V0 245 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 POM121L1PQ3SYA9 428 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TCEAL5Q5H9L2 206 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PLBD1Q6P4A8 553 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ARL9Q6T311 187 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 B3GLCTQ6Y288 498 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PAQR7Q86WK9 346 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TIGD4Q8IY51 512 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR6V1Q8N148 313 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZNF619Q8N2I2 560 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR2L3Q8NG85 312 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR7G2Q8NG99 324 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR2T4Q8NH00 348 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR5J2Q8NH18 312 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PFN4Q8NHR9 129 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CD99L2Q8TCZ2 262 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TMEM239Q8WW34 195 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ASB13Q8WXK3 278 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 SMIM10Q96HG1 83 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 C4orf36Q96KX1 117 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PRAP1Q96NZ9 151 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 STACQ99469 402 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 REG4Q9BYZ8 158 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RERGLQ9H628 205 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PRSS16Q9NQE7 514 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 WDR45Q9Y484 360 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MAB21L2Q9Y586 359 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ETV7Q9Y603 341 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 FER1L5A0AVI2 2057 aa3.5□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 A0A0G2JN53 185 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 FAM183AA6NL82 134 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 HMSDA8MTL9 139 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZNF879B4DU55 563 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PDCD5O14737 125 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 REM1O75628 298 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 AQP8O94778 261 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR2A4O95047 310 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 IGF2P01344 180 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 IFNGP01579 166 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 IFNA16P05015 189 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PCCBP05166 539 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CD3GP09693 182 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RAB40ALP0C0E4 278 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ACSM4P0C7M7 580 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CALCBP10092 127 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 IFI30P13284 250 aa3.49□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZNF250P15622 560 aa3.49□□□□□ -1.85
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