RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF254	O75437	659 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLAT	P00750	562 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	MZT1	Q08AG7	82 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	DOK3	Q7L591	496 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC29	Q8WV35	223 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOL4	Q9BPW4	351 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRI1	Q9BV20	369 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFA2	O43678	99 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	CIB2	O75838	187 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTR	P02766	147 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP9	P14780	707 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPY4R	P50391	375 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXCR4	P61073	352 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL5RA	Q01344	420 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNJ8	Q15842	424 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR38	Q5JTN6	314 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6ZSR3	168 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIGC	Q92535	297 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2F	Q969M7	185 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	MICU1	Q9BPX6	476 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRO	Q9BYG7	248 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR84	Q9NQS5	396 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		10.52	□□□□□ -0.72
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GTI1	187 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	DVL1	O14640	695 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOL3	O95236	402 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALPL	P05186	524 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	FPR2	P25090	351 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	HTR1F	P30939	366 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNAL	P38405	381 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGF12	P61328	243 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNCB	Q16143	134 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	STUM	Q69YW2	141 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	GID4	Q8IVV7	300 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	EME1	Q96AY2	570 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	MNT	Q99583	582 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCL13	Q99616	98 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014		R4GMQ9	66 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHBDL1	O75783	438 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFF1	P04155	84 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	SFTPB	P07988	381 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	SELL	P14151	372 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAH	P16930	419 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP2K3	P46734	347 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	TGM4	P49221	684 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPM6A	P51674	278 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	EGR3	Q06889	387 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP78	Q5JTW2	689 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73

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