RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 LAMP2P13473 410 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 BMP5P22003 454 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 EDNRAP25101 427 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GDI1P31150 447 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SOAT1P35610 550 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 AQP2P41181 271 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR3A2P47893 321 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DIO1P49895 249 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 UBE2KP61086 200 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ADAM8P78325 824 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CDK3Q00526 305 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 BEX5Q5H9J7 111 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FAM166AQ6J272 317 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GRHL3Q8TE85 626 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FRZBQ92765 325 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NEIL2Q969S2 332 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MOB3AQ96BX8 217 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 LYSMD1Q96S90 227 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 LPAR4Q99677 370 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SGPP1Q9BX95 441 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MS4A8Q9BY19 250 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR52D1Q9H346 318 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PDE7BQ9NP56 450 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PLXNA2O75051 1894 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TMEM212A6NML5 194 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IQCF5A8MTL0 148 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RNF212BA8MTL3 300 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HIDE1A8MVS5 230 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 F6UZH7 168 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SFT2D2O95562 160 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ELFN1P0C7U0 828 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 LIPCP11150 499 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PTHLHP12272 177 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TDGF1P13385 188 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IRF2P14316 349 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CD22P20273 847 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IMPA1P29218 277 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 P2RY1P47900 373 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DGKEP52429 567 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PRPS1P60891 318 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PAFAH1B2P68402 229 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZXDBP98169 803 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PPP1R1AQ13522 171 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CRMP1Q14194 572 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR7A5Q15622 319 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PSG3Q16557 428 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MAJINQ3KP22 176 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 AMZ1Q400G9 498 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MIDNQ504T8 468 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CHST9Q7L1S5 443 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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