RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR107Q5VW38 600 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 XAF1Q6GPH4 301 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 DRAM2Q6UX65 266 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SHFQ7M4L6 423 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SGCDQ92629 289 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC25A28Q96A46 364 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNFT2Q96EX2 444 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 DUX5Q96PT3 197 aa9.13□□□□□ -0.95
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APOBEC3C-202ENST00000428892 TEAD3Q99594 435 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNJ15Q99712 375 aa9.13□□□□□ -0.95
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APOBEC3C-202ENST00000428892 MSL2Q9HCI7 577 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.13□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.12□□□□□ -0.95
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APOBEC3C-202ENST00000428892 MYL12BO14950 172 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPRY3O43610 288 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 INMTO95050 263 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 LCATP04180 440 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 ALOX5APP20292 161 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC15A1P46059 708 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRKXP51817 358 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 IL13RA1P78552 427 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF91Q05481 1191 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC3A1Q07837 685 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLHL12Q53G59 568 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNLSQ5VYX0 342 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR2T2Q6IF00 324 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.12□□□□□ -0.95
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APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC30A2Q9BRI3 323 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 MND1Q9BWT6 205 aa9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
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APOBEC3C-202ENST00000428892 PRR32B1ATL7 298 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 MLNRO43193 412 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXO24O75426 580 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOXH1O75593 365 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 PF4P02776 101 aa9.11□□□□□ -0.95
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APOBEC3C-202ENST00000428892 HTR1FP30939 366 aa9.11□□□□□ -0.95
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APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF92Q03936 586 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIGD6Q17RP2 521 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPATC1Q76KD6 591 aa9.11□□□□□ -0.95
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APOBEC3C-202ENST00000428892 SPSB4Q96A44 273 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 ISOC1Q96CN7 298 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SIGLEC11Q96RL6 698 aa9.11□□□□□ -0.95
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APOBEC3C-202ENST00000428892 EGLN1Q9GZT9 426 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 CENPMQ9NSP4 180 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUP50Q9UKX7 468 aa9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 H0YL77 283 aa9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC2A1P11166 492 aa9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SELEP16581 610 aa9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC6A9P48067 706 aa9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 CX3CR1P49238 355 aa9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 HCCSP53701 268 aa9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 MALLQ13021 153 aa9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 IRF3Q14653 427 aa9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 MED22Q15528 200 aa9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa9.1□□□□□ -0.95
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR5AS1Q8N127 324 aa9.1□□□□□ -0.95
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