RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427230.2

NANOGP4-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP4, Length 913 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP4-201ENST00000427230 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 CTBP2P56545 445 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 FABP5Q01469 135 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 MXD1Q05195 221 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ACSM2AQ08AH3 577 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 C2orf80Q0P641 193 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 FGFBP1Q14512 234 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF273Q14593 569 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PGGHGQ32M88 737 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SYT14P1Q58G82 188 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ENTPD8Q5MY95 495 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 NCMAPQ5T1S8 102 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PAQR6Q6TCH4 344 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 DNAAF1Q8NEP3 725 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 OR11H7Q8NGC8 314 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 OR52N1Q8NH53 320 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 OR52J3Q8NH60 311 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 CDC26Q8NHZ8 85 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 GIMAP1Q8WWP7 306 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 DDB2Q92466 427 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PTP4A1Q93096 173 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 MAL2Q969L2 176 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 RFT1Q96AA3 541 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 S100PBPQ96BU1 408 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 RBP7Q96R05 134 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 BBS4Q96RK4 519 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 IL4I1Q96RQ9 567 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC35A5Q9BS91 424 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PRRG4Q9BZD6 226 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 OR51J1Q9H342 316 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 DPAGT1Q9H3H5 408 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 GLIPR2Q9H4G4 154 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 REEP4Q9H6H4 257 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM185BQ9H7F4 350 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PTGES2Q9H7Z7 377 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 A4GALTQ9NPC4 353 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PEMTQ9UBM1 199 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 MAB21L2Q9Y586 359 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 CACNG2Q9Y698 323 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TENM2Q9NT68 2774 aa4.77□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 A0A1W2PRB8 838 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 OR6C68A6NDL8 312 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 DPRXA6NFQ7 191 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 LINC01548A6NM66 108 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 A8MXK9 166 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TEX22C9J3V5 150 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 GABRPO00591 440 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 CTDSPLO15194 276 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PRAF2O60831 178 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SCO1O75880 301 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 LALBAP00709 142 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TGFAP01135 160 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 CD8AP01732 235 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 OPN1SWP03999 348 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 LIMS3P0CW19 117 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 LIMS4P0CW20 117 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 IFI30P13284 250 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ETFAP13804 333 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC25A16P16260 332 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF17P17021 662 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TNFRSF1BP20333 461 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 NPR2P20594 1047 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 GSTM3P21266 225 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 UQCRC2P22695 453 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 EDNRAP25101 427 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 AQP1P29972 269 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 GABRA3P34903 492 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 MPIP34949 423 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 CRATP43155 626 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 OR1E2P47887 323 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 INPP1P49441 399 aa4.76□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 DSCR9P59020 149 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms