RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 OR8G5Q8NG78 346 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 RTL8AQ9BWD3 113 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 MMP27Q9H306 513 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF442Q9H7R0 627 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CA10Q9NS85 328 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CRIM1Q9NZV1 1036 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 IFITM5A6NNB3 132 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS44E7EML9 344 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 J3QKU1 62 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 AIPO00170 330 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CLPXO76031 633 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF250P15622 560 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ADRA2CP18825 462 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CA6P23280 308 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 HTR2CP28335 458 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 RBP2P50120 134 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 NKPD1Q17RQ9 610 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CEACAM21Q3KPI0 293 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM42Q69YG0 159 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF529Q6P280 563 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR52N4Q8NGI2 321 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR5A2Q8NGI9 324 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR6M1Q8NGM8 313 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 UBASH3BQ8TF42 649 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 RNF170Q96K19 258 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 TSC22D3Q99576 134 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 MICU1Q9BPX6 476 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SYT3Q9BQG1 590 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 UQCC2Q9BRT2 126 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 BARHL1Q9BZE3 327 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PLK3Q9H4B4 646 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SMURF1Q9HCE7 757 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CYSLTR2Q9NS75 346 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ABRACLQ9P1F3 81 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 COMMD3Q9UBI1 195 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 STEAP1Q9UHE8 339 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 A3GALT2U3KPV4 340 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 A0A075B6Q4 140 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0G2JK05 382 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR5B21A6NL26 309 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SLC17A2O00624 439 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CYB5AP00167 134 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-13P01766 116 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PRF1P14222 555 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 MTCP1P56278 107 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 KISS1Q15726 138 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ALKBH6Q3KRA9 238 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 AWAT2Q6E213 333 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ASPHD2Q6ICH7 369 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SPERTQ8NA61 448 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 OR13G1Q8NGZ3 307 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM171Q8WVE6 324 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 RFT1Q96AA3 541 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SPACA5Q96QH8 159 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SLC30A2Q9BRI3 323 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 LIN7BQ9HAP6 207 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 C14orf119Q9NWQ9 140 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 TAAR3PQ9P1P4 343 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PEX16Q9Y5Y5 336 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SPTA1P02549 2419 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 WIPF3A6NGB9 483 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 FAM25AB3EWG3 89 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 FAM25CB3EWG5 89 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 FAM25GB3EWG6 89 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SHISA9B4DS77 424 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF732B4DXR9 585 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 C19orf84I3L1E1 186 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 GOSR1O95249 250 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM225BP0DP42 221 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 CALCBP10092 127 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 PLA2G2AP14555 144 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ARSBP15848 533 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 TNFSF4P23510 183 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 POU3F4P49335 361 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 GPM6AP51674 278 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 SCAND1P57086 179 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 GNG3P63215 75 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 RIN1Q13671 783 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 DMRTC1Q5HYR2 192 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 C1orf100Q5SVJ3 147 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 NR2C2APQ86WQ0 139 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ANGPTL5Q86XS5 388 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF573Q86YE8 665 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRK-201ENST00000368202 FBXL14Q8N1E6 418 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms