RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 SNU13P55769 128 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 PDZK1IP1Q13113 114 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 THEM4Q5T1C6 240 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 OGFOD3Q6PK18 319 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 Q7L0L9 218 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 EHFQ9NZC4 300 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 SDK1Q7Z5N4 2213 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 ADAMTS20P59510 1910 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 NUDT19A8MXV4 375 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 CAV2P51636 162 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 GABREP78334 506 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 UEVLDQ8IX04 471 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 PLPP5Q8NEB5 264 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 OR56B1Q8NGI3 324 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 GLYATL2Q8WU03 294 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 MOB1AQ9H8S9 216 aa16.55■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 METTL12A8MUP2 240 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 MED6O75586 246 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 KNG1P01042 644 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 SFTPBP07988 381 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 SFTA3P0C7M3 94 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 HKR1P10072 659 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 PLPPR5Q32ZL2 321 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 LYZL4Q96KX0 146 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 OR10A2Q9H208 303 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 ZNF708P17019 499 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 CD27P26842 260 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 ACY1Q03154 408 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 FGF21Q9NSA1 209 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 IGHG1P01857 330 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 CCL1P22362 96 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 PTGDSP41222 190 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 OR3A2P47893 321 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD37Q7Z713 158 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 DMBX1Q8NFW5 382 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 TAF9BQ9HBM6 251 aa16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 FBXO24O75426 580 aa16.52■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.52■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.52■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 TSTD1Q8NFU3 115 aa16.52■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.52■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa16.52■□□□□ 0.24
CITED2-201ENST00000367651 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 FAM157AC9JC47 383 aa16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 MSTNO14793 375 aa16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 FCGR3AP08637 254 aa16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 KISS1Q15726 138 aa16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 PECRQ9BY49 303 aa16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 BIN3Q9NQY0 253 aa16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 PISDQ9UG56 409 aa16.52■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 HEXAP06865 529 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 QDPRP09417 244 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 SERPINA2P20848 420 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 CD80P33681 288 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 AVPI1Q5T686 147 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 TMEM268Q5VZI3 342 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 BTNL8Q6UX41 500 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 OR10G3Q8NGC4 313 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 DNAJB11Q9UBS4 358 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 COLCA2A8K830 154 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 CD5P06127 495 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 AKR1C3P42330 323 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 DOK3Q7L591 496 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 RNF138Q8WVD3 245 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 OR5B2Q96R09 309 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 SMIM3Q9BZL3 60 aa16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CITED2-201ENST00000367651 WIF1Q9Y5W5 379 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms