RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 CD83Q01151 205 aa23.27■■□□□ 1.32
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HOXD8-201ENST00000313173 BANF2Q9H503 90 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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HOXD8-201ENST00000313173 STEAP1BQ6NZ63 245 aa23.26■■□□□ 1.31
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HOXD8-201ENST00000313173 MED28Q9H204 178 aa23.25■■□□□ 1.31
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HOXD8-201ENST00000313173 ZNF584Q8IVC4 421 aa23.23■■□□□ 1.31
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HOXD8-201ENST00000313173 CD276Q5ZPR3 534 aa23.22■■□□□ 1.31
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HOXD8-201ENST00000313173 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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HOXD8-201ENST00000313173 SSUH2Q9Y2M2 353 aa23.22■■□□□ 1.31
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HOXD8-201ENST00000313173 PDGFAP04085 211 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 MGMTP16455 207 aa23.21■■□□□ 1.31
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HOXD8-201ENST00000313173 STEAP2Q8NFT2 490 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 BORCS8Q96FH0 119 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 BEX1Q9HBH7 125 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD8-201ENST00000313173 OR14I1A6ND48 311 aa23.21■■□□□ 1.31
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