RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 QRFPP83859 136 aa6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 OR4C3Q8NH37 302 aa6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 TVP23CQ96ET8 276 aa6.41□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.41□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 E5RGE8 158 aa6.4□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 CSF2RAP15509 400 aa6.4□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 SP3Q02447 781 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 ARFRP1Q13795 201 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 PCK2Q16822 640 aa6.4□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.4□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 LIPHQ8WWY8 451 aa6.4□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 SMIM10Q96HG1 83 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 GPR87Q9BY21 358 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 Q9N2J8 555 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 NSG2Q9Y328 171 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 R4GMQ9 66 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 SOCS1O15524 211 aa6.4□□□□□ -1.38
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CSDE1-201ENST00000261443 C5orf34Q96MH7 638 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 EHFQ9NZC4 300 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.4□□□□□ -1.38
CSDE1-201ENST00000261443 NOTCH4Q99466 2003 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 K7N7A8 449 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 M0R143 59 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 GPR137BO60478 399 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 DFFBO76075 338 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 MPIG6BO95866 241 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 CHRM2P08172 466 aa6.4□□□□□ -1.39
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CSDE1-201ENST00000261443 PTGER4P35408 488 aa6.4□□□□□ -1.39
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CSDE1-201ENST00000261443 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.4□□□□□ -1.39
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CSDE1-201ENST00000261443 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.4□□□□□ -1.39
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CSDE1-201ENST00000261443 OR52N5Q8NH56 324 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 R3HDM4Q96D70 268 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 LYRM4Q9HD34 91 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.4□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.39□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.39□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 A8MVM7 634 aa6.39□□□□□ -1.39
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