RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, human

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00963-215	ENST00000622972	CDC42	P60953	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	CXCR4	P61073	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	IL5RA	Q01344	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ROM1	Q03395	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF92	Q03936	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ARL9	Q6T311	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GGH	Q92820	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		A0A0G2JMP0	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		A0A0X1KG70	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		F5H5K5	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		H0YL77	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972		M0R135	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SLC1A7	O00341	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	MLNR	O43193	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PLPP2	O43688	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	FAM20B	O75063	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RP2	O75695	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF205	O95201	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	VENTX	O95231	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	TTR	P02766	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	LYN	P07948	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF823	P16415	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	SELE	P16581	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	TNFSF4	P23510	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ACKR3	P25106	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	CX3CR1	P49238	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	MMP15	P51511	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR12D2	P58182	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PCBD1	P61457	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PPP1CB	P62140	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	PSG7	Q13046	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	IL18R1	Q13478	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	IRF3	Q14653	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC00963-215	ENST00000622972	RORB	Q92753	470 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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