RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 A0A1B0GVI7 797 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 MYL12BO14950 172 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 SYT7O43581 403 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 MT-ND2P03891 347 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 DAOP14920 347 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 TNFSF4P23510 183 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 COL8A2P25067 703 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 GABARAPL2P60520 117 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 ACSM1Q08AH1 577 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 DOC2BQ14184 412 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 CDK5R1Q15078 307 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 FTMTQ8N4E7 242 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 SPERTQ8NA61 448 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 MND1Q9BWT6 205 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 AKAP9Q99996 3911 aa14.97□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM212A6NML5 194 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 F5H5P2 479 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF12P17014 697 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 ACHEP22303 614 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 CRYBB2P43320 205 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 DSCR9P59020 149 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 MAB21L1Q13394 359 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 SPHARQ15513 63 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 OR8G1Q15617 311 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 Q5PR19 223 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM42Q69YG0 159 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 RDH5Q92781 318 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 OR2V2Q96R30 315 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 HHLA2Q9UM44 414 aa14.96□□□□□ -0.01
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 FAHP16930 419 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 GNALP38405 381 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 CD200P41217 278 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 TAS2R43P59537 309 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 BDH1Q02338 343 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF525Q8N782 197 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 PIGCQ92535 297 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 YIPF5Q969M3 257 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 C10orf35Q96D05 121 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 SMIM19Q96E16 107 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 OR5M11Q96RB7 305 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 ABCB9Q9NP78 766 aa14.95□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 LYNX1G3V0Z9 82 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 H3BSH0 61 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 PLPP2O43688 288 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 LMX1BO60663 402 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 RP2O75695 350 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 CD1AP06126 327 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 CSF3P09919 207 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 LYNX1P0DP58 116 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 TNFRSF1AP19438 455 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 GATA4P43694 442 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 PRDX4Q13162 271 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 WFDC11Q8NEX6 87 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 GHSRQ92847 366 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 ITPKCQ96DU7 683 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 DLL4Q9NR61 685 aa14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 OTOGQ6ZRI0 2925 aa14.93□□□□□ -0.02
ZNF548-204ENST00000594693 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms