RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 F5H5P2 479 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK1P06493 297 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNALP38405 381 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35A2P78381 396 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRNQ5BIV9 151 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZSR3 168 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPERTQ8NA61 448 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 YIPF5Q969M3 257 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEGF10Q96KG7 1140 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TANC2Q9HCD6 1990 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GVI7 797 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRS7CA6NNS2 312 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC14BO60729 498 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CST4P01036 141 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGM4P49221 684 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB37Q5TC79 503 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT74Q7RTS7 529 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIMREGQ9BSJ6 248 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 V9GYS6 101 aa28.05■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 E9PI62 339 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYT7O43581 403 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RP2O75695 350 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ISG15P05161 165 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRHBPP24387 322 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD200P41217 278 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAB21L1Q13394 359 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 HFEQ30201 348 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM244Q5VVB8 128 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC54Q8NEL0 328 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP21Q9H596 190 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGLQ9Y2B2 252 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MPC1Q9Y5U8 109 aa28.04■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM64A6NGJ6 449 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM64BA6NI03 449 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIFP27352 417 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC58Q4VC31 144 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNLSQ5VYX0 342 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR14K1Q8NGZ2 314 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCB9Q9NP78 766 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 BABAM2Q9NXR7 383 aa28.03■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4C45A6NMZ5 311 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYL12BO14950 172 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A16P16260 332 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 MZT1Q08AG7 82 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIN1Q13671 783 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8S1Q8NH09 359 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GATAD2BQ8WXI9 593 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENPP5Q9UJA9 477 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 BLOC1S6Q9UL45 172 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERGIC3Q9Y282 383 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 DYSFO75923 2080 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAHP16930 419 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 GATA4P43694 442 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM33P57088 247 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 RDH10Q8IZV5 341 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF485Q8NCK3 441 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGCQ92535 297 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL17Q92583 94 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDCA4Q9BXL8 241 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBAP1Q9NZ09 502 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNG2Q9Y698 323 aa28.02■■■□□ 2.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM212A6NML5 194 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANXA2P2A6NMY6 339 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF12P17014 697 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRDX4Q13162 271 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCM1Q9NP62 436 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM36Q9NQ86 728 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 C14orf119Q9NWQ9 140 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF850A8MQ14 1090 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 VWC2LB2RUY7 222 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 XAF1Q6GPH4 301 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF676Q8N7Q3 588 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 NANOGP1Q8N7R0 232 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGCDQ92629 289 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITPKCQ96DU7 683 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 BPESC1Q9GZL8 116 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHA1Q9HB21 404 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 TREM2Q9NZC2 230 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPSAP08865 295 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 WNT4P56705 351 aa27.99■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa27.99■■■□□ 2.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERGIC1Q969X5 290 aa27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms