RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 B4DSR2 109 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ZNF205O95201 554 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 EGR1P18146 543 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PEX2P28328 305 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 CD200P41217 278 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MMP16P51512 607 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 BTG1P62324 171 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ACTC1P68032 377 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ACTA1P68133 377 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 OCLNQ16625 522 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ODF4Q2M2E3 257 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 TTC23Q5W5X9 447 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SSX6Q7RTT6 188 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 KLBQ86Z14 1044 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SPICQ8N5J4 248 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 OR51F2Q8NH61 342 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PIGCQ92535 297 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ERGIC1Q969X5 290 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SOX7Q9BT81 388 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 BEX2Q9BXY8 128 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 GPR84Q9NQS5 396 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 FAM206AQ9NX38 181 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 AASSQ9UDR5 926 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 GNG8Q9UK08 70 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 R4GMQ9 66 aa6.56□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 A0A0U1RQV5 110 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 A0A1B0GVI7 797 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PRR32B1ATL7 298 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 FAM157AC9JC47 383 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PPIAL4DF5H284 164 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 TMEM178BH3BS89 294 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SLC16A6O15403 523 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 FAM20BO75063 409 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ALX3O95076 343 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ATP6V1B1P15313 513 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PCMT1P22061 227 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 CFPP27918 469 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 LMO4P61968 165 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ZNF91Q05481 1191 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PRDX4Q13162 271 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MAB21L1Q13394 359 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 OR8B8Q15620 311 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MPPED2Q15777 294 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 TP53I3Q53FA7 332 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 KLHL22Q53GT1 634 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SETD9Q8NE22 299 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 RNF170Q96K19 258 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 LYZL4Q96KX0 146 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MICU1Q9BPX6 476 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 AMBNQ9NP70 447 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ABCB9Q9NP78 766 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 RNF7Q9UBF6 113 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.55□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.54□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 A0A1B0GWJ7 208 aa6.54□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 H3BSH0 61 aa6.54□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 J3QLW9 94 aa6.54□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 P2RY10O00398 339 aa6.54□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 SULT1C4O75897 302 aa6.54□□□□□ -1.36
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