RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560514.1

TSPAN3-208, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-208ENST00000560514 FAHP16930 419 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 NUDT2P50583 147 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SMIM11AP58511 58 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 AANATQ16613 207 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 RFX4Q33E94 735 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 C7orf34Q96L11 122 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 B9D1Q9UPM9 204 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 TENM3Q9P273 2699 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 H0YAE9 185 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 DCTN6O00399 190 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ANGPTL7O43827 346 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 TXNDC12O95881 172 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 OMPP47874 163 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 OPA3Q9H6K4 179 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 COL7A1Q02388 2944 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ZNF823P16415 610 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 NDUFB7P17568 137 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 TGM4P49221 684 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 GMFBP60983 142 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 KRT72Q14CN4 511 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 DRAM2Q6UX65 266 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 OR6V1Q8N148 313 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 C17orf50Q8WW18 174 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 MED30Q96HR3 178 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ADA2Q9NZK5 511 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 TIPRLO75663 272 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 PF4V1P10720 104 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 NCK1P16333 377 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 DDOSTP39656 456 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 WDR82Q6UXN9 313 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 NMNAT3Q96T66 252 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 FUZQ9BT04 418 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.48□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 A0A1W2PRX2 142 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 E9PQ18 207 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 CHST1O43916 411 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 GLCEO94923 617 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 PF4P02776 101 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SELLP14151 372 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 BMXP51813 675 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 LGALS4P56470 323 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 CSNK2BP67870 215 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SLC35A2P78381 396 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 TAF13Q15543 124 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 STUMQ69YW2 141 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SEH1LQ96EE3 360 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 PYURFQ96I23 114 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ZNF702PQ9H963 129 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.47□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 UNC119BA6NIH7 251 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 ARPC3O15145 178 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 XRCC2O43543 280 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 IDH3BO43837 385 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 HSD17B1P14061 328 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 NOS3P29474 1203 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 GNALP38405 381 aa14.46□□□□□ -0.09
TSPAN3-208ENST00000560514 SPATS1Q496A3 300 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms