RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-208ENST00000546997 COMMD9Q9P000 198 aa14.55□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 OR5H14A6NHG9 310 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 LIPT2A6NK58 231 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 PRR32B1ATL7 298 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 PLPP3O14495 311 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 PLGLB1Q02325 96 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 ACKR1Q16570 336 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 STOML3Q8TAV4 291 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 SYT4Q9H2B2 425 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TMEM82A0PJX8 343 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TTLL8A6PVC2 850 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 ZFPL1O95159 310 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 HPNP05981 417 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 OR4E1P0C645 316 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 ACHEP22303 614 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 PSMB10P40306 273 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 CDC20BQ86Y33 519 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 OR6S1Q8NH40 331 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 ZNF519Q8TB69 540 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 SEC11CQ9BY50 192 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TMEM100Q9NV29 134 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.54□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TVP23AA6NH52 213 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 HSPB2A8KAH6 182 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 PSMD9O00233 223 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 XKRYO14609 159 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 OR6A2O95222 327 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 GFRA1P56159 465 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TMPRSS3P57727 454 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TAS2R19P59542 299 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 RAC1P63000 192 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 CXADRP78310 365 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 NAAAQ02083 359 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 HSPB2Q16082 182 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 EXTL1Q92935 676 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 GPR31O00270 319 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 AKR7A3O95154 331 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 IGHMP01871 453 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 GTF2F2P13984 249 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 KLK2P20151 261 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 PRSS3P35030 304 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 CLDN12P56749 244 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 TBR1Q16650 682 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 KDM8Q8N371 416 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 ARL11Q969Q4 196 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 C12orf49Q9H741 205 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 RNF122Q9H9V4 155 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 ALKBH4Q9NXW9 302 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.53□□□□□ -0.08
BRF1-208ENST00000546997 PRSS37A4D1T9 235 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 CD79AP11912 226 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 ADRA2CP18825 462 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 GGNQ86UU5 652 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 THAP6Q8TBB0 222 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 GPX8Q8TED1 209 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 WDR76Q9H967 626 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 B9D1Q9UPM9 204 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 LIPGQ9Y5X9 500 aa14.52□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 ACACBO00763 2458 aa14.51□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 A0A087WV48 116 aa14.51□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 A0A0J9YW62 118 aa14.51□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.51□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 MS4A18H0YCH9 400 aa14.51□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 CTAG2O75638 210 aa14.51□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 GPANK1O95872 356 aa14.51□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 BDKRB2P30411 391 aa14.51□□□□□ -0.09
BRF1-208ENST00000546997 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms