RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	CDS1	Q92903	461 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	ISOC2	Q96AB3	205 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	RCN3	Q96D15	328 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	C18orf15	Q96N68	181 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	CRLF2	Q9HC73	371 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	LGALS9	O00182	355 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	GABRR2	P28476	465 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	PCK1	P35558	622 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	DAOA	P59103	153 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	NAB1	Q13506	487 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	OR1Q1	Q15612	314 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	TSC22D1	Q15714	1073 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	ERO1B	Q86YB8	467 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	ENKUR	Q8TC29	256 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	OR4K3	Q96R72	315 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	NUDT9	Q9BW91	350 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	REEP1	Q9H902	201 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRC42	Q9Y546	428 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-208	ENST00000495802	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A0A6YYD5	115 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	IGKV1-17	P01599	117 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	TRBV12-3	P01733	135 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	THRA	P10827	490 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	APLNR	P35414	380 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	OR1G1	P47890	313 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	UBE2E1	P51965	193 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	DOC2A	Q14183	400 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	DMC1	Q14565	340 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	PRR9	Q5T870	116 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	ULK3	Q6PHR2	472 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	DRAM1	Q8N682	238 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	EMC6	Q9BV81	110 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	OR2AG1	Q9H205	316 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	TREX1	Q9NSU2	369 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802		H3BN98	237 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802		M0R1X1	148 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	PMCH	P20382	165 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	PSMB5	P28074	263 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	CLDN6	P56747	220 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	LCN2	P80188	198 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	C6orf99	Q4VX62	202 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	PP632	Q6XCG6	107 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802		Q6ZSR6	202 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC35G3	Q8N808	338 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	RDH12	Q96NR8	316 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	IL22	Q9GZX6	179 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	RGCC	Q9H4X1	137 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	ADA2	Q9NZK5	511 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A0B4J2E0	115 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	HACD1	B0YJ81	288 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	MANBA	O00462	879 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	PTH	P01270	115 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	IGLV2-8	P01709	118 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	PEX19	P40855	299 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	BCAP31	P51572	246 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	MLIP	Q5VWP3	458 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	STEAP4	Q687X5	459 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-208	ENST00000495802	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		2.56	□□□□□ -2

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