RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 FGFRL1Q8N441 504 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 OR8S1Q8NH09 359 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 LYZL4Q96KX0 146 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF747Q9BV97 191 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 SP140LQ9H930 580 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A19Q9HC21 320 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 BRD7Q9NPI1 651 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 DUX4Q9UBX2 424 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 CMYA5Q8N3K9 4069 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF879B4DU55 563 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 GNGT2O14610 69 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 FKBP6O75344 327 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 H2BFMP0C1H6 154 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 DEFB112Q30KQ8 113 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM236Q5W0B7 351 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 CD276Q5ZPR3 534 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF454Q8N9F8 522 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC29Q8WV35 223 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 SIRPDQ9H106 197 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 OR10A2Q9H208 303 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 POMPQ9Y244 141 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 HMGN1P05114 100 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 CFL1P23528 166 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 CBX1P83916 185 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 FLOT2Q14254 428 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A28Q96A46 364 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 SEH1LQ96EE3 360 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 PGAM5Q96HS1 289 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 RGCCQ9H4X1 137 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJB9Q9UBS3 223 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 DYNC1I1O14576 645 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 E2F6O75461 281 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 ANXA8P13928 327 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 AMY2BP19961 511 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 ALOX5APP20292 161 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 GFOD2Q3B7J2 385 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 DNAL1Q4LDG9 190 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 SLC35D3Q5M8T2 416 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 SPATA24Q86W54 205 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 GALNT4Q8N4A0 578 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 PCGF1Q9BSM1 259 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 DVL1O14640 695 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 GYG2O15488 501 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 TIPRLO75663 272 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 LIPFP07098 398 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 BPIFB3P59826 476 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 OR8B12Q8NGG6 310 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 SGMS2Q8NHU3 365 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 THEM6Q8WUY1 208 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 WDFY2Q96P53 400 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 LRP12Q9Y561 859 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC182A6NF36 153 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 PRR32B1ATL7 298 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 SRRM5B3KS81 715 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 P2RY10O00398 339 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 HCCSP53701 268 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 FAM76BQ5HYJ3 339 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 WDR38Q5JTN6 314 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 GPR157Q5UAW9 335 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 BTN2A1Q7KYR7 527 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 KRT74Q7RTS7 529 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 HPSE2Q8WWQ2 592 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF556Q9HAH1 456 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 CDIPTO14735 213 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 TMPRSS2O15393 492 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 TOX4O94842 621 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 CST4P01036 141 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 PRDX4Q13162 271 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 FAHD1Q6P587 224 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 OR5P3Q8WZ94 311 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 CCL13Q99616 98 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 MPC1Q9Y5U8 109 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 DCTDP32321 178 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 DAPP51397 102 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 APOFQ13790 326 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 Q6YL49 198 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 LY6G5BQ8NDX9 201 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 NRBF2Q96F24 287 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF850A8MQ14 1090 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-211ENST00000490677 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms