RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		14.54	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	DAPL1	A0PJW8	107 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ISPD	A4D126	451 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	DLGAP1	O14490	977 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	GMDS	O60547	372 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC2A1	P11166	492 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ADRA2C	P18825	462 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	DDOST	P39656	456 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	CD200	P41217	278 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	TBX5	Q99593	518 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	MIOX	Q9UGB7	285 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		14.53	□□□□□ -0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SULT1C4	O75897	302 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V1G2	O95670	118 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	FSHB	P01225	129 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRB1	P18505	474 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA13	P48723	471 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP16	P51512	607 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MZT1	Q08AG7	82 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB40B	Q12829	278 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MED21	Q13503	144 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRN	Q5BIV9	151 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5AS1	Q8N127	324 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	FTMT	Q8N4E7	242 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	COPS3	Q9UNS2	423 aa		14.52	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL15	A6NJ78	407 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMD9	O00233	223 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MLNR	O43193	412 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	APOL3	O95236	402 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT2	P09544	360 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	HILS1	P60008	231 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTA2	P62736	377 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTG2	P63267	376 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF92	Q03936	586 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYND11	Q15326	602 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SPSB4	Q96A44	273 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	REEP6	Q96HR9	211 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM165	Q9HC07	324 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	AVP	P01185	164 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	EPHA1	P21709	976 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	FPR2	P25090	351 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF91	Q05481	1191 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ESCO2	Q56NI9	601 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	COMMD2	Q86X83	199 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OCEL1	Q9H607	264 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OPN4	Q9UHM6	478 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		14.5	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CD300LB	A8K4G0	201 aa		14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CLIC3	O95833	236 aa		14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF12	P17014	697 aa		14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CSNK2B	P67870	215 aa		14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ8	Q15842	424 aa		14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		14.49	□□□□□ -0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		14.49	□□□□□ -0.09

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