RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 C2orf50Q96LR7 162 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CD180Q99467 661 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GFI1Q99684 422 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GINS3Q9BRX5 216 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RAB33BQ9H082 229 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZBP1Q9H171 429 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CHODLQ9H9P2 273 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SGK2Q9HBY8 427 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NOX4Q9NPH5 578 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 KIAA1456Q9P272 454 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.38□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CBY3A6NI87 242 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CLDN5O00501 218 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC17A2O00624 439 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 KAT7O95251 611 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IGLV3-27P01718 113 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ARG1P05089 322 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PRSS56P0CW18 603 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 THEGLP0DJG4 465 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PNLIPP16233 465 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SDHBP21912 280 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ARL3P36405 182 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ACVR1BP36896 505 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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PKP4-211ENST00000481115 OR12D2P58182 307 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 UBE2G2P60604 165 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H3AP68431 136 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 UBE2V1Q13404 147 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FAM189A2Q15884 450 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TAF9Q16594 264 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 EIPR1Q53HC9 387 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 WSCD1Q658N2 575 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MDGA2Q7Z553 956 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR2L13Q8N349 312 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RNF175Q8N4F7 328 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SEH1LQ96EE3 360 aa6.37□□□□□ -1.39
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PKP4-211ENST00000481115 MYADMQ96S97 322 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ATG101Q9BSB4 218 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CHST6Q9GZX3 395 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.37□□□□□ -1.39
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PKP4-211ENST00000481115 Q9N2J8 555 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IL17BQ9UHF5 180 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DAPP1Q9UN19 280 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SCML2Q9UQR0 700 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SZT2Q5T011 3432 aa6.37□□□□□ -1.39
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PKP4-211ENST00000481115 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TSPAN11A1L157 253 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C5orf51A6NDU8 294 aa6.36□□□□□ -1.39
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PKP4-211ENST00000481115 DUXAA6NLW8 204 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 A8MVM7 634 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 C9orf172C9J069 976 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TMEM238C9JI98 176 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 H3BQ15 152 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PIN1P1O15428 100 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CYB5BO43169 146 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 WDR1O75083 606 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SOCS5O75159 536 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HPRT1P00492 218 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HBE1P02100 147 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TRGC2P03986 189 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OR8U9P0C7N5 309 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 SCGB1A1P11684 91 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FGF5P12034 268 aa6.36□□□□□ -1.39
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