RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 WNT3P56703 355 aa6.04□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 GSG1Q2KHT4 349 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB6CQ53S08 254 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SERHLQ9NQF3 203 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 IDSB3KWA1 339 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF878C9JN71 531 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 KLK10O43240 276 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 RAD51DO75771 328 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MPC1LP0DKB6 136 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MIPP30301 263 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 GLRXP35754 106 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R43P59537 309 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAM8P78325 824 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 XKR7Q5GH72 579 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OCC1Q8TAD7 63 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 NKD1Q969G9 470 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB40CQ96S21 281 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PRS3 328 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MT-ND4P03905 459 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 COX20Q5RI15 118 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 AWAT2Q6E213 333 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM225Q6GV28 225 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF611Q8N823 705 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR26Q8NDV2 337 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ELOA3Q8NG57 546 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MAS1P04201 325 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 CSRP3P50461 194 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPK14Q16539 360 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 CLEC14AQ86T13 490 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM25Q86YD3 366 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2T33Q8NG76 320 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ISL2Q96A47 359 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 DERL1Q9BUN8 251 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.03□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 C22orf42Q6IC83 251 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 BEST3Q8N1M1 668 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC58Q96CX6 371 aa6.03□□□□□ -1.44
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