RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 H0YL77 283 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 EFSO43281 561 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR8B4Q96RC9 309 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PLK3Q9H4B4 646 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FHITP49789 147 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZNF787Q6DD87 383 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 Q7L0L9 218 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TSLPQ969D9 159 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ARPC3O15145 178 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TRAPPC6AO75865 159 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TIMP1P01033 207 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PVRP15151 417 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 DEFB103AP81534 67 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 STACQ99469 402 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR51I2Q9H344 312 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 HLA-HP01893 362 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PIGPP57054 158 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SLC37A1P57057 533 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 BTF3L4Q96K17 158 aa14.89□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 F5H5K5 113 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CDKN3Q16667 212 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SSSCA1O60232 199 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TLE1Q04724 770 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 DUSP2Q05923 314 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FIGNL2A6NMB9 653 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OTOSQ8NHW6 89 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 BADQ92934 168 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ABHD6Q9BV23 337 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CHST5Q9GZS9 411 aa14.88□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OPRM1P35372 400 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ERV3-1Q14264 604 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 WDR92Q96MX6 357 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 LRIT1Q9P2V4 623 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FGF17O60258 216 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OPN1MWP04001 364 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SERPINE2P07093 398 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 HTD2P86397 168 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ALG14Q96F25 216 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ADAM19Q9H013 955 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PNV4 684 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZNF320A2RRD8 509 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 EPPINO95925 133 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 IL2RGP31785 369 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR3A1P47881 315 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 HIST1H3AP68431 136 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 LANCL2Q9NS86 450 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 MARCH5Q9NX47 278 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PPC1 479 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ABLIM3O94929 683 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FCGR2AP12318 317 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PAX5Q02548 391 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 TLE3Q04726 772 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 FAM57BQ71RH2 274 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 MYOTQ9UBF9 498 aa14.87□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 ZNF264O43296 627 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 BPNT1O95861 308 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SEC11BP0C7V7 166 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 KRTDAPP60985 99 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 RANP62826 216 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.86□□□□□ -0.03
PACS1-201ENST00000320580 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms