RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD5Q9GZQ3 224 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 NDRG3Q9UGV2 375 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 DVL1O14640 695 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 RRP8O43159 456 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 TXNDC12O95881 172 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FUT3P21217 361 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR2B8PP59922 312 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 TDHQ8IZJ6 230 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 GINS3Q9BRX5 216 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 MAGT1Q9H0U3 335 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ERHP84090 104 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 WDR38Q5JTN6 314 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR13D1Q8NGV5 346 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ALG14Q96F25 216 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf141Q9NUB4 165 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 GPR31O00270 319 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC3BP05452 202 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 RRASP10301 218 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 METAP1P53582 386 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FXNQ16595 210 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZFPL1O95159 310 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM16Q2WEN9 425 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf10Q9HB07 376 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 GP1BAP07359 652 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ABCD3P28288 659 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR1J1Q8NGS3 322 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR4C3Q8NH37 302 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR5B3Q8NH48 314 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FOXB1Q99853 325 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 TRIB1Q96RU8 372 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF391Q9UJN7 358 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 V9GYS6 101 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 GABRG2P18507 467 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 LILRA6Q6PI73 481 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR10X1Q8NGY0 326 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR2W5A6NFC9 320 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS23O95084 383 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 AVPR2P30518 371 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR1F12Q8NHA8 337 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 TVP23CQ96ET8 276 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 RHOFQ9HBH0 211 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FAM157BP0CG42 384 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 PDZD11Q5EBL8 140 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 HMGCLL1Q8TB92 370 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 SCN7AQ01118 1682 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CPN1P15169 458 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF117Q03924 483 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 RNF212Q495C1 297 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FOXQ1Q9C009 403 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 PCMT1P22061 227 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FUT7Q11130 342 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM21Q3B7S5 101 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FAM162BQ5T6X4 162 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 MRGPRX3Q96LB0 322 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRL4Q9HBW9 690 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CDAP32320 146 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 BPIFB3P59826 476 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 MYBPHQ13203 477 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 NCR3LG1Q68D85 454 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 DRAM2Q6UX65 266 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01555Q8NAE3 123 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR52N4Q8NGI2 321 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35D1Q9NTN3 355 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 WNT1P04628 370 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 NME1P15531 152 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB108BQ8NET1 73 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 AKR7LQ8NHP1 331 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 PRRX2Q99811 253 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF251Q9BRH9 671 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 MYO7AQ13402 2215 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FIGNL2A6NMB9 653 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ROBO4Q8WZ75 1007 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A20A6NK97 555 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 RAB35Q15286 201 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CLRN3Q8NCR9 226 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 EXTL1Q92935 676 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 GALMQ96C23 342 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR2A5Q96R48 311 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPTL7O43827 346 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR7C2O60412 319 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CTSVO60911 334 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf58Q96LI9 332 aa18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms