RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 METTL24Q5JXM2 366 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 TICAM2Q86XR7 235 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 NLRP3Q96P20 1036 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYH3P11055 1940 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 MCCP23508 829 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 GREM2Q9H772 168 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP5JP18859 108 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 LAMB2P55268 1798 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-210ENST00000617904 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC93Q567U6 631 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEC24BO95487 1268 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRC24Q50LG9 513 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 OLFM4Q6UX06 510 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYNE4Q8N205 404 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A1B0GUL7 405 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP2B3Q16720 1220 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL27Q8NEV9 243 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCC12Q96J65 1359 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 POTEIP0CG38 1075 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 POTEJP0CG39 1038 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHMLP26374 656 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF609O15014 1411 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC5A1P13866 664 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 FSD1Q9BTV5 496 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDE8BO95263 885 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALDH1B1P30837 517 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRY2Q49AN0 593 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHADLQ6NUI6 762 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-210ENST00000617904 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 LPIN2Q92539 896 aa20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAD50Q92878 1312 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 SNED1Q8TER0 1413 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 HAUS7Q99871 368 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 AK9Q5TCS8 1911 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 TIMM10P62072 90 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 XAGE2Q96GT9 111 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCN4AP35499 1836 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 FZD9O00144 591 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 PSMD1Q99460 953 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP26Q9BXU7 913 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 CREBZFQ9NS37 354 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 LDHDQ86WU2 507 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSCBQ8IWL3 235 aa20.21■□□□□ 0.83
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