RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568566.5

TSC2-223, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 3

Gene TSC2, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-223	ENST00000568566	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TSC2-223	ENST00000568566	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TSC2-223	ENST00000568566	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TSC2-223	ENST00000568566	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TSC2-223	ENST00000568566		G3V3G9	751 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	PLIN1	O60240	522 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	SCARF1	Q14162	830 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	MOB2	Q70IA6	237 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	BEND3	Q5T5X7	828 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	PSME4	Q14997	1843 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF609	O15014	1411 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	TBC1D8	O95759	1140 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	RLBP1	P12271	317 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	GGA1	Q9UJY5	639 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	CASP7	P55210	303 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	FKBP1B	P68106	108 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	HTT	P42858	3142 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	USP17L8	P0C7I0	530 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	TRIM27	P14373	513 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	GCKR	Q14397	625 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	PANK1	Q8TE04	598 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566		H7C1W4	665 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	KAZALD1	Q96I82	304 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	GML	Q99445	158 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	MXD3	Q9BW11	206 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	XDH	P47989	1333 aa		10.58	□□□□□ -0.71
TSC2-223	ENST00000568566	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	GPR25	O00155	361 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	FBXW7	Q969H0	707 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	USP44	Q9H0E7	712 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	SASH1	O94885	1247 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	PRKG1	Q13976	671 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	SUCLG2	Q96I99	432 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	PTPRC	P08575	1304 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	CENPF	P49454	3210 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	NF2	P35240	595 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	TM4SF4	P48230	202 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	FOXO4	P98177	505 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	SREBF2	Q12772	1141 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	MEIS3	Q99687	375 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	MED23	Q9ULK4	1368 aa		10.55	□□□□□ -0.72
TSC2-223	ENST00000568566	CEP290	O15078	2479 aa		10.55	□□□□□ -0.72

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