RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		14.56	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	MX1	P20591	662 aa		14.56	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	RGS3	P49796	1198 aa		14.56	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	TIMM10	P62072	90 aa		14.56	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		14.56	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	ERC2	O15083	957 aa		14.55	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	FGFR2	P21802	821 aa		14.55	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	OLFM4	Q6UX06	510 aa		14.55	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		14.55	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		14.55	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	XAGE2	Q96GT9	111 aa		14.55	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		14.55	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	MED23	Q9ULK4	1368 aa		14.55	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	WASHC4	Q2M389	1173 aa		14.54	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		14.54	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		14.54	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	MYH7	P12883	1935 aa		14.54	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	SNAP23	O00161	211 aa		14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	SLC51A	Q86UW1	340 aa		14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	PSMD1	Q99460	953 aa		14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	POLL	Q9UGP5	575 aa		14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		14.53	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	SBF1	O95248	1867 aa		14.52	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	AOX1	Q06278	1338 aa		14.52	□□□□□ -0.08
DDB1-223	ENST00000543658	RIMBP2	O15034	1052 aa		14.52	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	ADORA1	P30542	326 aa		14.52	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	PSME4	Q14997	1843 aa		14.52	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	SNED1	Q8TER0	1413 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	PPIP5K2	O43314	1243 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	PDE4A	P27815	886 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	GYG1	P46976	350 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	PDE1A	P54750	535 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	GPR162	Q16538	588 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC102B	Q68D86	513 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	PHKA1	P46020	1223 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	BCAM	P50895	628 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	VPS33B	Q9H267	617 aa		14.5	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	SEMA3E	O15041	775 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	KLRK1	P26718	216 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	AOC3	Q16853	763 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	COA1	Q9GZY4	146 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	STAP2	Q9UGK3	403 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	DOCK2	Q92608	1830 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	ATP5J	P18859	108 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	RASSF7	Q02833	373 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	SKAP1	Q86WV1	359 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	NIM1K	Q8IY84	436 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	JDP2	Q8WYK2	163 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	FBXW7	Q969H0	707 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	NFKBIE	O00221	500 aa		14.47	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	GRIN3B	O60391	1043 aa		14.47	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	TTC22	Q5TAA0	569 aa		14.47	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		14.47	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		14.47	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		14.47	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	CD209	Q9NNX6	404 aa		14.47	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
DDB1-223	ENST00000543658	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		14.46	□□□□□ -0.09

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