RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538860.1

ADD1-223, Transcript of adducin 1, human

TSL 3

Gene ADD1, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-223	ENST00000538860	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	HSPA6	P17066	643 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	FGFR2	P21802	821 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	MMP14	P50281	582 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	DOK7	Q18PE1	504 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	DPF2	Q92785	391 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	RRAGC	Q9HB90	399 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF609	O15014	1411 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	IL1R1	P14778	569 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	CEP85	Q6P2H3	762 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	LPIN2	Q92539	896 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	AAMP	Q13685	434 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	CD209	Q9NNX6	404 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	USP17L3	A6NCW0	530 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	USP17L4	A6NCW7	530 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	RAD17	O75943	681 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	TOMM70	O94826	608 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	HACL1	Q9UJ83	578 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	SNAP23	O00161	211 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	PSMD14	O00487	310 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	HMMR	O75330	724 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	SASH1	O94885	1247 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	SCNN1D	P51172	638 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	SIL1	Q9H173	461 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	SPEF2	Q9C093	1822 aa		18.39	■□□□□ 0.54
ADD1-223	ENST00000538860	KLRK1	P26718	216 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	GPR108	Q9NPR9	543 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	SLC5A1	P13866	664 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	GML	Q99445	158 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	EPHX2	P34913	555 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	ATP2B3	Q16720	1220 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	DACT2	Q5SW24	774 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	SCN4A	P35499	1836 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	FSTL1	Q12841	308 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860		A0A1B0GUL6	1792 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860		H7C1D1	291 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	EPS15	P42566	896 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	GYG1	P46976	350 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	TFCP2	Q12800	502 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	SEMA3E	O15041	775 aa		18.34	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	LDHD	Q86WU2	507 aa		18.34	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
ADD1-223	ENST00000538860	RAB11FIP3	O75154	756 aa		18.33	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	BCAM	P50895	628 aa		18.33	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	GTF2I	P78347	998 aa		18.33	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		18.33	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		18.33	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860		A0A1B0GUL7	405 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	USP17L8	P0C7I0	530 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	MICALL2	Q8IY33	904 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	TIMM10	P62072	90 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ADD1-223	ENST00000538860	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms