RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 C1QTNF8P60827 252 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 COPRSQ9NQ92 184 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 CIAO1O76071 339 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF609O15014 1411 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE8BO95263 885 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 EPHX2P34913 555 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE3AQ14432 1141 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 SIL1Q9H173 461 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 COG6Q9Y2V7 657 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 EPS15P42566 896 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L3A6NCW0 530 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L4A6NCW7 530 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 CD209Q9NNX6 404 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-208ENST00000531226 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP8B2P98198 1209 aa23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 DPF2Q92785 391 aa23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 POTEIP0CG38 1075 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 POTEJP0CG39 1038 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 POLA2Q14181 598 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 IL1R1P14778 569 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 FGFR2P21802 821 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 FSTL1Q12841 308 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 LDHDQ86WU2 507 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 SSH3Q8TE77 659 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 GYG1P46976 350 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 MICALL2Q8IY33 904 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 DACT2Q5SW24 774 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP85Q6P2H3 762 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXW7Q969H0 707 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 SHTN1A0MZ66 631 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 H7C1D1 291 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC5A1P13866 664 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 CHADLQ6NUI6 762 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 LPIN2Q92539 896 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 GMLQ99445 158 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 GTF2IP78347 998 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP2B3Q16720 1220 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-208ENST00000531226 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 VPS37DQ86XT2 251 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 MXD3Q9BW11 206 aa23.56■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 SASH1O94885 1247 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 TFCP2Q12800 502 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.55■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L8P0C7I0 530 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 BCAMP50895 628 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPA6P17066 643 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-208ENST00000531226 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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