RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 NFKBIEO00221 500 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 GPR182O15218 404 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 CDC27P30260 824 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 KCNA1Q09470 495 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 PDE3BQ13370 1112 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 OSMRQ99650 979 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 PPME1Q9Y570 386 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 C9orf172C9J069 976 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 LINC01387J3KSC0 135 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 EDN3P14138 238 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 PTPRAP18433 802 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 EPHA1P21709 976 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 ORC1Q13415 861 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 USP21Q9UK80 565 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 GATA4P43694 442 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 SETDB1Q15047 1291 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 CITED4Q96RK1 184 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-215ENST00000506510 FAM177BA6PVY3 158 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 IGHA2P01877 340 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 ADGRE1Q14246 886 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 MBTPS1Q14703 1052 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 MUC3BQ9H195 1237 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 DLL1O00548 723 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 ADAM19Q9H013 955 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 MAPK1P28482 360 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 DOC2BQ14184 412 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 TMC7Q7Z402 723 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 NEFLP07196 543 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 NXPE3Q969Y0 559 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 METTL12A8MUP2 240 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 H3BRJ5 948 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 FURINP09958 794 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 CABP4P57796 275 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 NPHS2Q9NP85 383 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 SOX13Q9UN79 622 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 FSCN2O14926 492 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PP55 124 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 TM4SF5O14894 197 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 BSNDQ8WZ55 320 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-215ENST00000506510 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 ALX3O95076 343 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 WISP1O95388 367 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 NOS3P29474 1203 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 CSRNP1Q96S65 589 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 PIP4K2BP78356 416 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 HGSNATQ68CP4 663 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 TCF12Q99081 682 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 F8W735 103 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 ADAM11O75078 769 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 GRIA4P48058 902 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-215ENST00000506510 IKBKEQ14164 716 aa8.62□□□□□ -1.03
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