RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 DGAT1O75907 488 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 SDSP20132 328 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 GPTP24298 496 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC57Q2TAC2 916 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 PARP10Q53GL7 1025 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM182BQ5T319 152 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM89AQ96GI7 184 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 GLI3P10071 1580 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF40O75150 1001 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS6KA4O75676 772 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 PKDCCQ504Y2 493 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 AK7Q96M32 723 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 SIL1Q9H173 461 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC41PQ6P2S7 1318 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 CDHR2Q9BYE9 1310 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 SASH1O94885 1247 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMTA2O94983 1202 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 AACSQ86V21 672 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00116Q8NCU8 138 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 SALL3Q9BXA9 1300 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGB4P16144 1822 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMB4A4D0S4 1761 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 CSF1RP07333 972 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 IL15P40933 162 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM67Q6ZTA4 783 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 C22orf23Q9BZE7 217 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 ECHDC1Q9NTX5 307 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE8AO60658 829 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 ZPR1O75312 459 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 RILPL2Q969X0 211 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D32Q96NH3 1257 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-201ENST00000319942 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.34□□□□□ -0.434e-43■■■■■ 44.1
RABGGTB-201ENST00000319942 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 C3orf80F5H4A9 247 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 EYA2O00167 538 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 CIAO1O76071 339 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 RXRBP28702 533 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 CNTROBQ8N137 903 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 GNPATO15228 680 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 REC8O95072 547 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC19A1P41440 591 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNQ4P56696 695 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 COPS2P61201 443 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 TFCP2Q12800 502 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAPPC3LQ5T215 181 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 TTLL11Q8NHH1 800 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR108Q9NPR9 543 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP126Q9P2H0 1117 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 NARFQ9UHQ1 456 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SUSD4Q5VX71 490 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 TSHZ3Q63HK5 1081 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 PI4K2BQ8TCG2 481 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 AKAP2Q9Y2D5 859 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 DOT1LQ8TEK3 1739 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 RFC4P35249 363 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSWP56202 376 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR20EP86478 221 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR20CP86479 221 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR20DP86480 221 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR20BP86481 221 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR20AP86496 221 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 BECN1Q14457 450 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 TNNI3KQ59H18 835 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SLF2Q8IX21 1173 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 UBN2Q6ZU65 1347 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM37O94972 964 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGA6P23229 1130 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG9AQ7Z3C6 839 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNE4Q8N205 404 aa12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms