RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 NBPF14Q5TI25 921 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 NBPF15Q8N660 670 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 E7EWF7 191 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 GPAA1O43292 621 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 NR1I2O75469 434 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SERPINC1P01008 464 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 PHKBQ93100 1093 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 DIP2AQ14689 1571 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 MAP3K12Q12852 859 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 KIF20BQ96Q89 1820 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 A0A0G2JLW4 131 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 GREM2Q9H772 168 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 PDIA6Q15084 440 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 TMX1Q9H3N1 280 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SCRN1Q12765 414 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 TTC14Q96N46 770 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ALG1Q9BT22 464 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SSH2Q76I76 1423 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SPECC1Q5M775 1068 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 HAUS7Q99871 368 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SLC5A1P13866 664 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 TCIRG1Q13488 830 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 PRDM1O75626 825 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 MTX1Q13505 466 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 GTF3C6Q969F1 213 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ARMT1Q9H993 441 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 OSBP2Q969R2 916 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 USP28Q96RU2 1077 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 G3V3G9 751 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 HLFQ16534 295 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 OLFM4Q6UX06 510 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ZBTB9Q96C00 473 aa14.61□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 OFD1O75665 1012 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 MBD4O95243 580 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 FGAP02671 866 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 BRINP3Q76B58 766 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 M0R2C6 588 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 DDB1Q16531 1140 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 CFAP100Q494V2 611 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 INCENPQ9NQS7 918 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 CYP7A1P22680 504 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 LRMPQ12912 555 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 SMIM5Q71RC9 77 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 CBX8Q9HC52 389 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ZBTB43O43298 467 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 FAM182BQ5T319 152 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 MAST3O60307 1309 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 PHKA1P46020 1223 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 PIGBQ92521 554 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 ANO10Q9NW15 660 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 PXDNQ92626 1479 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.58□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.58□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
UBXN4-201ENST00000272638 NGLY1Q96IV0 654 aa14.58□□□□□ -0.08
UBXN4-201ENST00000272638 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.58□□□□□ -0.08
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms