RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ATP8B2P98198 1209 aa27.79■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 POLA2Q14181 598 aa27.79■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 TNIP1Q15025 636 aa27.79■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 METTL24Q5JXM2 366 aa27.79■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 SIL1Q9H173 461 aa27.79■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 PSME4Q14997 1843 aa27.78■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 TOMM70O94826 608 aa27.78■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 VIL1P09327 827 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 EPS15P42566 896 aa27.78■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.77■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 FGFR2P21802 821 aa27.77■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 CD209Q9NNX6 404 aa27.77■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.77■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 HACL1Q9UJ83 578 aa27.77■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 G3V3G9 751 aa27.76■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 POTEIP0CG38 1075 aa27.76■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 POTEJP0CG39 1038 aa27.76■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF8P60827 252 aa27.76■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 DCAF8Q5TAQ9 597 aa27.76■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 SSH3Q8TE77 659 aa27.76■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 GPRC5DQ9NZD1 345 aa27.76■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.76■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 SHTN1A0MZ66 631 aa27.74■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 EPHX2P34913 555 aa27.74■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 IL1R1P14778 569 aa27.73■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 CEP85Q6P2H3 762 aa27.73■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 DPF2Q92785 391 aa27.73■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 GMLQ99445 158 aa27.73■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 USP17L3A6NCW0 530 aa27.72■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 USP17L4A6NCW7 530 aa27.72■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 GYG1P46976 350 aa27.72■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 USP17L1Q7RTZ2 530 aa27.72■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 FBXO33Q7Z6M2 555 aa27.72■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 DACT2Q5SW24 774 aa27.71■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa27.71■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 ZNF609O15014 1411 aa27.71■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 MXD3Q9BW11 206 aa27.7■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.7■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
SYF2-201ENST00000236273 RPS12P25398 132 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 STRIP1Q5VSL9 837 aa27.69■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 ZNF804AQ7Z570 1209 aa27.69■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 TTLL5Q6EMB2 1281 aa27.68■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.68■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 LPIN2Q92539 896 aa27.68■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 GTF2IP78347 998 aa27.67■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 MICALL2Q8IY33 904 aa27.67■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 AGBL3Q8NEM8 1001 aa27.67■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 SASH1O94885 1247 aa27.67■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 BCAMP50895 628 aa27.67■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 TFCP2Q12800 502 aa27.67■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 EGFRP00533 1210 aa27.66■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 FSTL1Q12841 308 aa27.65■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 ATP2B3Q16720 1220 aa27.65■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 LDHDQ86WU2 507 aa27.65■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 CERS5Q8N5B7 392 aa27.65■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 SMC1BQ8NDV3 1235 aa27.65■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 TRPM4Q8TD43 1214 aa27.65■■■□□ 2.02
SYF2-201ENST00000236273 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 CHADLQ6NUI6 762 aa27.64■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 SAMD7Q7Z3H4 446 aa27.64■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.63■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 H7C1D1 291 aa27.63■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 SLC5A1P13866 664 aa27.63■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 TIMM10P62072 90 aa27.63■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 CAVIN4Q5BKX8 364 aa27.62■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 FBXW7Q969H0 707 aa27.62■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 PGAP2Q9UHJ9 254 aa27.62■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 JAG2Q9Y219 1238 aa27.62■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 ADORA1P30542 326 aa27.61■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 USP17L8P0C7I0 530 aa27.6■■■□□ 2.01
SYF2-201ENST00000236273 MYO3BQ8WXR4 1341 aa27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms