RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	SOX7	Q9BT81	388 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	SCN3B	Q9NY72	215 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	TREM2	Q9NZC2	230 aa		21.2	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM64B	A6NI03	449 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	GNAL	P38405	381 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	DDOST	P39656	456 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	ETV1	P50549	477 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	DSCR9	P59020	149 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	WDR38	Q5JTN6	314 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	FTMT	Q8N4E7	242 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	RDH5	Q92781	318 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	OR2V2	Q96R30	315 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	MAST4	O15021	2626 aa		21.19	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229		F5H5P2	479 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	MLNR	O43193	412 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	LIMS3	P0CW19	117 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	LIMS4	P0CW20	117 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	SYS1	Q8N2H4	156 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PELI1	Q96FA3	418 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	21.18	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GVI7	797 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PTGES3L	E9PB15	166 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	ADH4	P08319	380 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	MAP2K3	P46734	347 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	MVK	Q03426	396 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	TNK1	Q13470	666 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	OR8B8	Q15620	311 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	OR8S1	Q8NH09	359 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	JAM3	Q9BX67	310 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	SLC22A4	Q9H015	551 aa		21.17	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	CD55	P08174	381 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	TNFRSF1A	P19438	455 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	COL8A2	P25067	703 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	ACKR3	P25106	362 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	CSNK2B	P67870	215 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	SPRN	Q5BIV9	151 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF786	Q8N393	782 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PIGC	Q92535	297 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	YIPF5	Q969M3	257 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	IL19	Q9UHD0	177 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	MYL12B	O14950	172 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	DHRS3	O75911	302 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	KIR3DL2	P43630	455 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	HFE	Q30201	348 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	CCL17	Q92583	94 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF649	Q9BS31	505 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	CACNG2	Q9Y698	323 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	VPS13C	Q709C8	3753 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		21.15	■□□□□ 0.98
GPS1-223	ENST00000584229	RNF223	E7ERA6	249 aa		21.14	■□□□□ 0.97
GPS1-223	ENST00000584229	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.97
GPS1-223	ENST00000584229	SYT7	O43581	403 aa		21.14	■□□□□ 0.97
GPS1-223	ENST00000584229	GMDS	O60547	372 aa		21.14	■□□□□ 0.97
GPS1-223	ENST00000584229	FAH	P16930	419 aa		21.14	■□□□□ 0.97
GPS1-223	ENST00000584229	ACHE	P22303	614 aa		21.14	■□□□□ 0.97
GPS1-223	ENST00000584229	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.97
GPS1-223	ENST00000584229	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		21.14	■□□□□ 0.97
GPS1-223	ENST00000584229	DOK3	Q7L591	496 aa		21.14	■□□□□ 0.97
GPS1-223	ENST00000584229	KLB	Q86Z14	1044 aa		21.14	■□□□□ 0.97
GPS1-223	ENST00000584229	MYDGF	Q969H8	173 aa		21.14	■□□□□ 0.97

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