RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 ABCG5Q9H222 651 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 EXO5Q9H790 373 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SP140LQ9H930 580 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 TAS2R4Q9NYW5 299 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 EMC3Q9P0I2 261 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 CLEC4AQ9UMR7 237 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 DHDHQ9UQ10 334 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 MGAQ8IWI9 3026 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 LAMA5O15230 3695 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 A0A0U1RQV5 110 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 A6NIN4 97 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SLC17A2O00624 439 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 CTDSPLO15194 276 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ZNHIT1O43257 154 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 LANCL1O43813 399 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SSX4O60224 188 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SCGB1D1O95968 90 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 PTTG1O95997 202 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ITGA5P08648 1049 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 DBHP09172 617 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 FAM87AP0C7U9 286 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 PATE4P0C8F1 98 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SLC2A1P11166 492 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 B4GALT1P15291 398 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF24P17028 368 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF32P17041 273 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 AGTR1P30556 359 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 MNDAP41218 407 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 PTH2RP49190 550 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 PSMD7P51665 324 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 CLDN12P56749 244 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 PSG4Q00888 419 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 MADCAM1Q13477 382 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ASAH1Q13510 395 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 LY6DQ14210 128 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 PDCD1Q15116 288 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 TMEM177Q53S58 311 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 KRBOX4Q5JUW0 171 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF774Q6NX45 483 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 BEND4Q6ZU67 534 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 FAM57BQ71RH2 274 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 RNF144BQ7Z419 303 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 OR5AS1Q8N127 324 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 LRRC18Q8N456 261 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 OR13C3Q8NGS6 347 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 OR1F12Q8NHA8 337 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SETD6Q8TBK2 473 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SLC7A6Q92536 515 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 FGGYQ96C11 551 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ATP6V0BQ99437 205 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 MRI1Q9BV20 369 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 HDHD2Q9H0R4 259 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SLITRK2Q9H156 845 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 LDAHQ9H6V9 325 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 CALHM2Q9HA72 323 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 NOX3Q9HBY0 568 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 GPR84Q9NQS5 396 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 B3GNT2Q9NY97 397 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 MALT1Q9UDY8 824 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 ETV7Q9Y603 341 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 V9GYS6 101 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 MEGF11A6BM72 1044 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SLC22A20A6NK97 555 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 FAM25AB3EWG3 89 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 FAM25CB3EWG5 89 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 FAM25GB3EWG6 89 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 M0R135 149 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-210ENST00000561817 SGCEO43556 437 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms