RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, human

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BMP4-208	ENST00000559642	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	WDR86	Q86TI4	376 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	DNHD1	Q96M86	4753 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	FOXH1	O75593	365 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	APOL3	O95236	402 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ALPL	P05186	524 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ADRA2C	P18825	462 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ACKR3	P25106	362 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	DDOST	P39656	456 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	OR8B8	Q15620	311 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF404	Q494X3	552 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	GID4	Q8IVV7	300 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	OR8S1	Q8NH09	359 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	OR8B4	Q96RC9	309 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	RGCC	Q9H4X1	137 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	NIPAL2	Q9H841	368 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	MMP26	Q9NRE1	261 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	FAM206A	Q9NX38	181 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	RNF212B	A8MTL3	300 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	GNAL	P38405	381 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	CXCR4	P61073	352 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	CSNK2B	P67870	215 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ROM1	Q03395	351 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ESCO2	Q56NI9	601 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	SSX6	Q7RTT6	188 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	COMMD2	Q86X83	199 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	KLB	Q86Z14	1044 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	CBR4	Q8N4T8	237 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	TBX5	Q99593	518 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	APOL4	Q9BPW4	351 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	MRO	Q9BYG7	248 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	USE1	Q9NZ43	259 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	OPN4	Q9UHM6	478 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642		A8MXK9	166 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	WNT2	P09544	360 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	EGR1	P18146	543 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	PRDX4	Q13162	271 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	SPERT	Q8NA61	448 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	UBE2F	Q969M7	185 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	EME1	Q96AY2	570 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BMP4-208	ENST00000559642	S100A14	Q9HCY8	104 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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