RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF3	P17036	446 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	GLRX	P35754	106 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ALDH3B1	P43353	468 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEA2	P43356	314 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DAP	P51397	102 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CRISP1	P54107	249 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FXYD6P3	P58550	94 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ERVS71-1	P61550	626 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1CB	P62140	327 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CRMP1	Q14194	572 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ADIPOQ	Q15848	244 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SHE	Q5VZ18	495 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF544	Q6NX49	715 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ACSM6	Q6P461	480 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM122B	Q7Z309	247 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ADCK1	Q86TW2	530 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CPO	Q8IVL8	374 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	GJC3	Q8NFK1	279 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2T4	Q8NH00	348 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	NABP1	Q96AH0	204 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CMBL	Q96DG6	245 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	C4orf45	Q96LM5	186 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf198	Q9H425	327 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DECR2	Q9NUI1	292 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	IL20	Q9NYY1	176 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TREM2	Q9NZC2	230 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288		M0R233	179 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	BHLHE40	O14503	412 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ARPC3	O15145	178 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SPRY3	O43610	288 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SYNGR3	O43761	229 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MGRN1	O60291	552 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TXNDC12	O95881	172 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	NGF	P01138	241 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV4-39	P01824	125 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TF	P02787	698 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DAO	P14920	347 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	HSD11B1	P28845	292 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	GRK5	P34947	590 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PDLIM4	P50479	330 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PRKX	P51817	358 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	EFNA4	P52798	201 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	HCCS	P53701	268 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CCL8	P80075	99 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TNK1	Q13470	666 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	AQP6	Q13520	282 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	RIPK1	Q13546	671 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	APOF	Q13790	326 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	GGTLC2	Q14390	218 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	GK3P	Q14409	553 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP6AP1	Q15904	470 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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