RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 TRAPPC2LH3BP13 241 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 WNT2P09544 360 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 DDOSTP39656 456 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 OR8B8Q15620 311 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 ZNF404Q494X3 552 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 LCN1P1Q5VSP4 162 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 DCAF12L2Q5VW00 463 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 NXNL2Q5VZ03 156 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 ZNF826PQ6ZT77 177 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 ERGIC1Q969X5 290 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 PRRG3Q9BZD7 231 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 RIBC2Q9H4K1 309 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 ADGRL4Q9HBW9 690 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 FAM206AQ9NX38 181 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 RNF212BA8MTL3 300 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 A8MXK9 166 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 FOXH1O75593 365 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 FSTL3O95633 263 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 ADRA2CP18825 462 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 ROM1Q03395 351 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 KRT77Q7Z794 578 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 KLBQ86Z14 1044 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 PHC2Q8IXK0 858 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 DEFB108BQ8NET1 73 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 NIPAL2Q9H841 368 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 FN3KRPQ9HA64 309 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-222ENST00000550996 PPIAL4EA0A075B759 164 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 PPIAL4DF5H284 164 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 J3QLI3 93 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 ALPLP05186 524 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 PPIAL4FP0DN26 164 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 CFL1P23528 166 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 LYPD2Q6UXB3 125 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 C11orf53Q8IXP5 236 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 C1orf87Q8N0U7 546 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 PLPP7Q8NBV4 271 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 OR11L1Q8NGX0 322 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 OR8B4Q96RC9 309 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 RGCCQ9H4X1 137 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 C1orf123Q9NWV4 160 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 RNF7Q9UBF6 113 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 ENOPH1Q9UHY7 261 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 PPIAL4AQ9Y536 164 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 SLC22A31A6NKX4 558 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 EBAG9O00559 213 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 GRPP07492 148 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 IRF2P14316 349 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 RPS2P15880 293 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 CD80P33681 288 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 PAX2Q02962 417 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 DEGS2Q6QHC5 323 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 C1QL2Q7Z5L3 287 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 SLC35F2Q8IXU6 374 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 ZNF679Q8IYX0 411 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 SPERTQ8NA61 448 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 PPP1R14AQ96A00 147 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 C7orf69Q9H7B7 122 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 HAO2Q9NYQ3 351 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 E9PQ18 207 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 EI24O14681 340 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 FSHBP01225 129 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 ZNF12P17014 697 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 EGR1P18146 543 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 GATA3P23771 443 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 CSNK2BP67870 215 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 ESCO2Q56NI9 601 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 ZFP1Q6P2D0 407 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 SSX6Q7RTT6 188 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 ASB17Q8WXJ9 295 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 UBE2FQ969M7 185 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 ITPKCQ96DU7 683 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 APOL4Q9BPW4 351 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 USE1Q9NZ43 259 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 LRCH1Q9Y2L9 728 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 A6NLC8 198 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 C3orf80F5H4A9 247 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 APOL3O95236 402 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 CXCR4P61073 352 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-222ENST00000550996 ZNF154Q13106 437 aa17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms